RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	VAMP4	O75379	141 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	TUSC2	O75896	110 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	APP	P05067	770 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	POU2F2	P09086	479 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	VAV1	P15498	845 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	TERF1	P54274	439 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR85	P60893	370 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM193A	P78312	1265 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	TEK	Q02763	1124 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	TERF2	Q15554	542 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	KRT77	Q7Z794	578 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2C3	Q8N628	320 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	EFHB	Q8N7U6	833 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	NAXE	Q8NCW5	288 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM169	Q96HH4	297 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	PIK3C2G	O75747	1445 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		5.87	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		5.87	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		5.87	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF205	O95201	554 aa		5.87	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		5.87	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	POU4F1	Q01851	419 aa		5.87	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	BTK	Q06187	659 aa		5.87	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		5.87	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		5.87	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	RINL	Q6ZS11	566 aa		5.87	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		5.87	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		5.87	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		5.87	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		5.87	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		5.87	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		5.87	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	CDC23	Q9UJX2	597 aa		5.87	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	GJD2	Q9UKL4	321 aa		5.87	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		5.87	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	DIP2A	Q14689	1571 aa		5.86	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM227A	F5H4B4	570 aa		5.86	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	ARNTL	O00327	626 aa		5.86	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	MSC	O60682	206 aa		5.86	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	TBC1D8	O95759	1140 aa		5.86	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	PYGL	P06737	847 aa		5.86	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	PPM1A	P35813	382 aa		5.86	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	PRIM2	P49643	509 aa		5.86	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	TNFAIP2	Q03169	654 aa		5.86	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	PLCL1	Q15111	1095 aa		5.86	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		5.86	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		5.86	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		5.86	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	VPS11	Q9H270	941 aa		5.86	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		5.86	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		5.86	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	PDP2	Q9P2J9	529 aa		5.86	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		5.86	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		5.86	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		5.86	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	LAMC1	P11047	1609 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM82	A0PJX8	343 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	NCAM2	O15394	837 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	FKTN	O75072	461 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	CAPN3	P20807	821 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	ABCB4	P21439	1286 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	C5AR1	P21730	350 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	HSPA2	P54652	639 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	AMPD2	Q01433	879 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	PDCD1	Q15116	288 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	RTP2	Q5QGT7	225 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	KRT78	Q8N1N4	520 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	MIER2	Q8N344	545 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-223	ENST00000636616	KIAA1191	Q96A73	305 aa		5.85	□□□□□ -1.47

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