RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619785.1

SENP3-210, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

TSL 3

Gene SENP3, Length 634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-210ENST00000619785 ADH7P40394 386 aa8.57□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 ANAPC15P60006 121 aa8.57□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 BFSP2Q13515 415 aa8.57□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 CNKSR3Q6P9H4 555 aa8.57□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa8.57□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 DEFB128Q7Z7B8 93 aa8.57□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 AACSQ86V21 672 aa8.57□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 FAM160B2Q86V87 743 aa8.57□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 CPXCR1Q8N123 301 aa8.57□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 KCNB2Q92953 911 aa8.57□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 GAL3ST3Q96A11 431 aa8.57□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 PRRX2Q99811 253 aa8.57□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 MAF1Q9H063 256 aa8.57□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 RNF146Q9NTX7 359 aa8.57□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 FANCLQ9NW38 375 aa8.57□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 TTC3P53804 2025 aa8.57□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 GSG1L2A8MUP6 293 aa8.56□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 GOLIM4O00461 696 aa8.56□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 BMP3P12645 472 aa8.56□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 ATP5JP18859 108 aa8.56□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 STAT2P52630 851 aa8.56□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 DEFB103AP81534 67 aa8.56□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 PKN1Q16512 942 aa8.56□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 MTERF2Q49AM1 385 aa8.56□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa8.56□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa8.56□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 SV2AQ7L0J3 742 aa8.56□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 HOMER1Q86YM7 354 aa8.56□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 ADHFE1Q8IWW8 467 aa8.56□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 AMOTL1Q8IY63 956 aa8.56□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.56□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 CEP95Q96GE4 821 aa8.56□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 GPATCH3Q96I76 525 aa8.56□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 SAMD11Q96NU1 681 aa8.56□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 HAUS7Q99871 368 aa8.56□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 EHMT1Q9H9B1 1298 aa8.56□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 PAG1Q9NWQ8 432 aa8.56□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 FRRS1LQ9P0K9 344 aa8.56□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 DACH1Q9UI36 760 aa8.56□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 ZNF292O60281 2723 aa8.56□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 KAT6AQ92794 2004 aa8.55□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 NBNO60934 754 aa8.55□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 DDAH1O94760 285 aa8.55□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 TTLL1O95922 423 aa8.55□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 SELPP16109 830 aa8.55□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 MX2P20592 715 aa8.55□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 KCNA5P22460 613 aa8.55□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 ADH6P28332 368 aa8.55□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 LTBRP36941 435 aa8.55□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 ARL4DP49703 201 aa8.55□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 GSTM4Q03013 218 aa8.55□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa8.55□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 TCTN1Q2MV58 587 aa8.55□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 TIGD5Q53EQ6 642 aa8.55□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa8.55□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 VWA5B2Q8N398 1253 aa8.55□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 PRSS33Q8NF86 280 aa8.55□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 NEDD1Q8NHV4 660 aa8.55□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 CHURC1Q8WUH1 139 aa8.55□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 STAG1Q8WVM7 1258 aa8.55□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 MFSD14AQ96MC6 490 aa8.55□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 LPIN3Q9BQK8 851 aa8.55□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 CTNNA3Q9UI47 895 aa8.55□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 NAGPAQ9UK23 515 aa8.55□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 PROB1E7EW31 1015 aa8.54□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 H3BNC9 293 aa8.54□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 H3BRJ5 948 aa8.54□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 NCK2O43639 380 aa8.54□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 DNAJC6O75061 913 aa8.54□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 ICAM1P05362 532 aa8.54□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 LINC00271P0C7V0 271 aa8.54□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 KCNJ6P48051 423 aa8.54□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 TCF15Q12870 199 aa8.54□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 LAPTM4AQ15012 233 aa8.54□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 MUM1L1Q5H9M0 696 aa8.54□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa8.54□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 FAM117BQ6P1L5 589 aa8.54□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 CCDC62Q6P9F0 684 aa8.54□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 BTNL9Q6UXG8 535 aa8.54□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa8.54□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa8.54□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 LILRB2Q8N423 598 aa8.54□□□□□ -1.04
SENP3-210ENST00000619785 SLC7A3Q8WY07 619 aa8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms