RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 HBP1O60381 514 aa23.7■■□□□ 1.38
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SGMS1-210ENST00000619438 JAK3P52333 1124 aa23.7■■□□□ 1.38
SGMS1-210ENST00000619438 ASIC1P78348 528 aa23.7■■□□□ 1.38
SGMS1-210ENST00000619438 TAF2Q6P1X5 1199 aa23.7■■□□□ 1.38
SGMS1-210ENST00000619438 RSPH3Q86UC2 560 aa23.7■■□□□ 1.38
SGMS1-210ENST00000619438 ETNPPLQ8TBG4 499 aa23.7■■□□□ 1.38
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF592Q92610 1267 aa23.7■■□□□ 1.38
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SGMS1-210ENST00000619438 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa23.7■■□□□ 1.38
SGMS1-210ENST00000619438 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
SGMS1-210ENST00000619438 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
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SGMS1-210ENST00000619438 UNC13DQ70J99 1090 aa23.69■■□□□ 1.38
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SGMS1-210ENST00000619438 SNX29Q8TEQ0 813 aa23.68■■□□□ 1.38
SGMS1-210ENST00000619438 L2HGDHQ9H9P8 463 aa23.68■■□□□ 1.38
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SGMS1-210ENST00000619438 ZNF507Q8TCN5 953 aa23.65■■□□□ 1.38
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SGMS1-210ENST00000619438 MTHFD1LQ6UB35 978 aa23.64■■□□□ 1.38
SGMS1-210ENST00000619438 DEFB123Q8N688 67 aa23.64■■□□□ 1.38
SGMS1-210ENST00000619438 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa23.64■■□□□ 1.38
SGMS1-210ENST00000619438 KIAA0895Q8NCT3 520 aa23.64■■□□□ 1.38
SGMS1-210ENST00000619438 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa23.64■■□□□ 1.38
SGMS1-210ENST00000619438 CXCL10P02778 98 aa23.64■■□□□ 1.37
SGMS1-210ENST00000619438 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
SGMS1-210ENST00000619438 CASP14P31944 242 aa23.64■■□□□ 1.37
SGMS1-210ENST00000619438 CNKSR3Q6P9H4 555 aa23.64■■□□□ 1.37
SGMS1-210ENST00000619438 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
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