RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605833.1

VIM-AS1-202, VIM antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene VIM-AS1, Length 918 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIM-AS1-202ENST00000605833 NOMO2Q5JPE7 1267 aa23.42■■□□□ 1.34
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VIM-AS1-202ENST00000605833 B3GNT9Q6UX72 402 aa23.42■■□□□ 1.34
VIM-AS1-202ENST00000605833 UBALD2Q8IYN6 164 aa23.42■■□□□ 1.34
VIM-AS1-202ENST00000605833 FBXL16Q8N461 479 aa23.42■■□□□ 1.34
VIM-AS1-202ENST00000605833 RDM1Q8NG50 284 aa23.42■■□□□ 1.34
VIM-AS1-202ENST00000605833 IGSF21Q96ID5 467 aa23.42■■□□□ 1.34
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VIM-AS1-202ENST00000605833 SH3GLB2Q9NR46 395 aa23.42■■□□□ 1.34
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VIM-AS1-202ENST00000605833 TRAIPQ9BWF2 469 aa23.41■■□□□ 1.34
VIM-AS1-202ENST00000605833 DMDP11532 3685 aa23.4■■□□□ 1.34
VIM-AS1-202ENST00000605833 MAFO75444 373 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
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VIM-AS1-202ENST00000605833 SLC22A17Q8WUG5 538 aa23.4■■□□□ 1.34
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VIM-AS1-202ENST00000605833 ARID2Q68CP9 1835 aa23.4■■□□□ 1.34
VIM-AS1-202ENST00000605833 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 OFD1O75665 1012 aa23.39■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 CDC42EP1Q00587 391 aa23.39■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 PTPN14Q15678 1187 aa23.39■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZNF280BQ86YH2 543 aa23.39■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 TRIM22Q8IYM9 498 aa23.39■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 BLIDQ8IZY5 108 aa23.39■■□□□ 1.33
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VIM-AS1-202ENST00000605833 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 IRAK3Q9Y616 596 aa23.39■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa23.38■■□□□ 1.33
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VIM-AS1-202ENST00000605833 SLC37A4O43826 429 aa23.38■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 SKIP12755 728 aa23.38■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 CYP3A7P24462 503 aa23.38■■□□□ 1.33
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VIM-AS1-202ENST00000605833 CABP7Q86V35 215 aa23.38■■□□□ 1.33
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VIM-AS1-202ENST00000605833 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.38■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
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VIM-AS1-202ENST00000605833 RAB27AP51159 221 aa23.37■■□□□ 1.33
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VIM-AS1-202ENST00000605833 NPEPPSP55786 919 aa23.37■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 EVCP57679 992 aa23.37■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 INF2Q27J81 1249 aa23.37■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa23.37■■□□□ 1.33
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VIM-AS1-202ENST00000605833 IFT122Q9HBG6 1241 aa23.37■■□□□ 1.33
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VIM-AS1-202ENST00000605833 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa23.36■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 SFXN1Q9H9B4 322 aa23.36■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 CYP26B1Q9NR63 512 aa23.36■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa23.36■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZNF623O75123 536 aa23.35■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 DEXIO95424 95 aa23.35■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 STK3Q13188 491 aa23.35■■□□□ 1.33
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VIM-AS1-202ENST00000605833 TMEM143Q96AN5 459 aa23.35■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 PGBD4Q96DM1 585 aa23.35■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 MFSD1Q9H3U5 465 aa23.35■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 MINDY3Q9H8M7 445 aa23.35■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 VAV3Q9UKW4 847 aa23.35■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 CPLX1O14810 134 aa23.34■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa23.34■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 LETM2Q2VYF4 491 aa23.34■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
VIM-AS1-202ENST00000605833 MOXD1Q6UVY6 613 aa23.34■■□□□ 1.33
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