RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590466.2

UBXN6-206, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN6, Length 803 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-206ENST00000590466 BSNDQ8WZ55 320 aa22.44■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 PNMA5Q96PV4 448 aa22.44■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 DNM3Q9UQ16 869 aa22.44■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 HOXA2O43364 376 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 TSPAN1O60635 241 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 UBXN11Q5T124 520 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 MICALL1Q8N3F8 863 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 P2RX5Q93086 422 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 CWH43Q9H720 699 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 FAM105AQ9NUU6 356 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 HCSTQ9UBK5 93 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 CLIC4Q9Y696 253 aa22.43■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 SKIP12755 728 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 GRIN1Q05586 938 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 AK8Q96MA6 479 aa22.42■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 NLRC5Q86WI3 1866 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 GRM6O15303 877 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 AXLP30530 894 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 RAB27AP51159 221 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 RNF169Q8NCN4 708 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 POLD4Q9HCU8 107 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 MEIS3P2A8K0S8 358 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 SLC26A4O43511 780 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 ERLIN2O94905 339 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 CAMK1Q14012 370 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 PTPROQ16827 1216 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 LPPQ93052 612 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 RUSC1Q9BVN2 902 aa22.4■■□□□ 1.18
UBXN6-206ENST00000590466 ITGB1P05556 798 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 LONP1P36776 959 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 NAMPTP43490 491 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 FAM187BQ17R55 369 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 CABP7Q86V35 215 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 DAW1Q8N136 415 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 KLHL23Q8NBE8 558 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 SPPL3Q8TCT6 385 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 HELQQ8TDG4 1101 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 KIFAP3Q92845 792 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 CCDC51Q96ER9 411 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 CPB2Q96IY4 423 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 FZD8Q9H461 694 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 REV3LO60673 3130 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 B4GALT5O43286 388 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 DNAJB1P25685 340 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 MAPK7Q13164 816 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 NOTUMQ6P988 496 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 AGMOQ6ZNB7 445 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 ABI1Q8IZP0 508 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 LRRC43Q8N309 656 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 LRRC15Q8TF66 581 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 USP28Q96RU2 1077 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 PLIN2Q99541 437 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 CSRNP2Q9H175 543 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 KIAA1671Q9BY89 1806 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 OFD1O75665 1012 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 SLC12A3P55017 1021 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 PPP2R5AQ15172 486 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 LONRF3Q496Y0 759 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 RSPH1Q8WYR4 309 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 PGBD4Q96DM1 585 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 AAASQ9NRG9 546 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 A0A1B0GUA9 196 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 TTLL13PA6NNM8 815 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 LAG3P18627 525 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN6-206ENST00000590466 GUCY2CP25092 1073 aa22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms