RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 AZI2Q9H6S1 392 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 KBTBD4Q9NVX7 518 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 HDAC6Q9UBN7 1215 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 DNM3Q9UQ16 869 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 GRIN2DO15399 1336 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 HAS3O00219 553 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 HIP1RO75146 1068 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 PPFIA4O75335 1185 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 LYPLA2O95372 231 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 F2P00734 622 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 BMP6P22004 513 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 CPT1AP50416 773 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 CASP5P51878 434 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM62Q0P6H9 643 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 COASYQ13057 564 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 PPFIA1Q13136 1202 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 EMC2Q15006 297 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 GRIK4Q16099 956 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 NBPF20Q3BBV1 942 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 XKR3Q5GH77 459 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM47CQ5HY64 1035 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM102BQ5T8I3 360 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 RUFY4Q6ZNE9 571 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 C1orf186Q6ZWK4 172 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 GAS2L3Q86XJ1 694 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 Q8N3U1 123 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC155Q8N6L0 562 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 AFAP1L1Q8TED9 768 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP8B4Q8TF62 1192 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 LMBR1Q8WVP7 490 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 WNT8BQ93098 351 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 SMARCE1Q969G3 411 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 VTI1AQ96AJ9 217 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF333Q96JL9 665 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 TIGD1Q96MW7 591 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 CEP89Q96ST8 783 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 C7orf25Q9BPX7 421 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP26B1Q9NR63 512 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKEF1Q9NU02 776 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 ERAP1Q9NZ08 941 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 NRBP1Q9UHY1 535 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1W2PQY0 241 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR37O15354 613 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 TREHO43280 583 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM13AO94988 1023 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 C22orf31O95567 290 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 VTNP04004 478 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 RPN1P04843 607 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 MYBP10242 640 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 PTMSP20962 102 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 KLRC1P26715 233 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 NMT1P30419 496 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 SARSP49591 514 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 ACLYP53396 1101 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 STX17P56962 302 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 ARID5BQ14865 1188 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 DPCR1Q3MIW9 517 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 MARCH8Q5T0T0 291 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 KLHL10Q6JEL2 608 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 METTL13Q8N6R0 699 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 KIAA0895Q8NCT3 520 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 FUCA2Q9BTY2 467 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 SPC25Q9HBM1 224 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 PDLIM7Q9NR12 457 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 NRBP2Q9NSY0 501 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 PANK4Q9NVE7 773 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 USP25Q9UHP3 1055 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 TUBE1Q9UJT0 475 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-208ENST00000589162 Q9Y3F1 56 aa6.68□□□□□ -1.34
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