RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A087WWV3 80 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-209ENST00000587957 C5orf67F2Z3F1 127 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-209ENST00000587957 USO1O60763 962 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-209ENST00000587957 RB1P06400 928 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-209ENST00000587957 OR52Z1P0C646 297 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-209ENST00000587957 LINC00271P0C7V0 271 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-209ENST00000587957 RFC5P40937 340 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-209ENST00000587957 DSC3Q14574 896 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-209ENST00000587957 TTC38Q5R3I4 469 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-209ENST00000587957 MAEAQ7L5Y9 396 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF410Q86VK4 478 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-209ENST00000587957 ECHDC2Q86YB7 292 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-209ENST00000587957 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-209ENST00000587957 HELQQ8TDG4 1101 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-209ENST00000587957 PIGOQ8TEQ8 1089 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-209ENST00000587957 CEP89Q96ST8 783 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-209ENST00000587957 MTRQ99707 1265 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-209ENST00000587957 PLVAPQ9BX97 442 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-209ENST00000587957 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-209ENST00000587957 AAASQ9NRG9 546 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-209ENST00000587957 CLDND1Q9NY35 253 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-209ENST00000587957 DACT1Q9NYF0 836 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-209ENST00000587957 KIF3AQ9Y496 699 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-209ENST00000587957 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-209ENST00000587957 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 H3BQ06 376 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 HOXA2O43364 376 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 ITGB1P05556 798 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 CA8P35219 290 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 PBX3P40426 434 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 TECP42680 631 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 CDC42EP1Q00587 391 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 CLUL1Q15846 466 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 NOSTRINQ8IVI9 506 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 EXOC8Q8IYI6 725 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 CRIPAKQ8N1N5 446 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 LRRC43Q8N309 656 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 RNF149Q8NC42 400 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 NEK9Q8TD19 979 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 POF1BQ8WVV4 589 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 TCP11Q8WWU5 503 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 LPPQ93052 612 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM117Q9H0C3 514 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 LMAN2LQ9H0V9 348 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 PLAGL2Q9UPG8 496 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 VCANP13611 3396 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 H3BQV1 296 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 TNFRSF10AO00220 468 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 ERLIN2O94905 339 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 SLITRK3O94933 977 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 LAG3P18627 525 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 ERMNQ8TAM6 284 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 PPP2R3CQ969Q6 453 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 TMX3Q96JJ7 454 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 MTMR9Q96QG7 549 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 PPME1Q9Y570 386 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 MYO7AQ13402 2215 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 GAS2O43903 313 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 FGF18O76093 207 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 BMP1P13497 986 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 DNAJB1P25685 340 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 GJB2P29033 226 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 IRS1P35568 1242 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 PHKA2P46019 1235 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 TFDP1Q14186 410 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 CLLU1OSQ5K130 101 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 FERMT3Q86UX7 667 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 P2RX5Q93086 422 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF558Q96NG5 402 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 TBC1D32Q96NH3 1257 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 CASD1Q96PB1 797 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 GBP3Q9H0R5 595 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 RNF19AQ9NV58 838 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 SMC3Q9UQE7 1217 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A0U1RQF3 1178 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 ARHGEF35A5YM69 484 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 LRRIQ4A6NIV6 560 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 MED24O75448 989 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 DGAT1O75907 488 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-209ENST00000587957 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms