RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587074.1

CELF4-205, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

TSL 3

Gene CELF4, Length 411 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-205	ENST00000587074	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	DACT1	Q9NYF0	836 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074		H3BQV1	296 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	LAD1	O00515	517 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	ASAP2	O43150	1006 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	HOXA2	O43364	376 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	MUT	P22033	750 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	ARL2	P36404	184 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	PRPH	P41219	470 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	CAPS	Q13938	189 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	RNF149	Q8NC42	400 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	NACC1	Q96RE7	527 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	CWH43	Q9H720	699 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	HCST	Q9UBK5	93 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	DLL1	O00548	723 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	EOMES	O95936	686 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	ITGB1	P05556	798 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	GLRA2	P23416	452 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	DNAJB1	P25685	340 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	DDIT3	P35638	169 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	PHKA2	P46019	1235 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	PTEN	P60484	403 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	TFF2	Q03403	129 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	POU5F1B	Q06416	359 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	CAMK1	Q14012	370 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	PDIA5	Q14554	519 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	IL17A	Q16552	155 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	ECM1	Q16610	540 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	CASD1	Q96PB1	797 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	ASB2	Q96Q27	587 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	COG5	Q9UP83	839 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	MUC3A	Q02505	3323 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	ZNF623	O75123	536 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	RAB27A	P51159	221 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	TFDP1	Q14186	410 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	COL19A1	Q14993	1142 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	UBXN11	Q5T124	520 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	LRRC43	Q8N309	656 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	RNF169	Q8NCN4	708 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	HLA-C	Q95604	372 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	RAB34	Q9BZG1	259 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CELF4-205	ENST00000587074	MYH11	P35749	1972 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CELF4-205	ENST00000587074	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
CELF4-205	ENST00000587074	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
CELF4-205	ENST00000587074	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CELF4-205	ENST00000587074	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CELF4-205	ENST00000587074	PP2D1	A8MPX8	630 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CELF4-205	ENST00000587074	HAX1	O00165	279 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CELF4-205	ENST00000587074	TSPAN1	O60635	241 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CELF4-205	ENST00000587074	PPP1R37	O75864	691 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CELF4-205	ENST00000587074	SKI	P12755	728 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CELF4-205	ENST00000587074	LAG3	P18627	525 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CELF4-205	ENST00000587074	CYP11B2	P19099	503 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CELF4-205	ENST00000587074	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	11.08	□□□□□ -0.64
CELF4-205	ENST00000587074	AMHR2	Q16671	573 aa		11.08	□□□□□ -0.64

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