RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 FTLP02792 175 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 STAT3P40763 770 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 C1orf146Q5VVC0 180 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 KIAA1841Q6NSI8 718 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 FAM20AQ96MK3 541 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 STRIP2Q9ULQ0 834 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 RASSF10A6NK89 507 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 HAUS5O94927 633 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 ACAD11Q709F0 780 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 SEPT8Q92599 483 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 CEP95Q96GE4 821 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 VPS11Q9H270 941 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF711Q9Y462 761 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 KPNA7A9QM74 516 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 SNAP23O00161 211 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 PDLIM2Q96JY6 352 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 GPC3P51654 580 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 COPS2P61201 443 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 RGS9BPQ6ZS82 235 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 SNF8Q96H20 258 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 RMDN3Q96TC7 470 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 CYP26B1Q9NR63 512 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 GTSE1Q9NYZ3 720 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 DCTN4Q9UJW0 460 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 UTYO14607 1347 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 SUN2Q9UH99 717 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 FEM1BQ9UK73 627 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 SYF2O95926 243 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 BRAFP15056 766 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 KLC4Q9NSK0 619 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 DENND3A2RUS2 1198 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM259Q4ZIN3 620 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 PDXDC1Q6P996 788 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC37BQ96QE4 947 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 FAM96AQ9H5X1 160 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 IP6K2Q9UHH9 426 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 CAPN11Q9UMQ6 739 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 FAM187AA6NFU0 413 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 TNFAIP2Q03169 654 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 GPS1Q13098 491 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC14Q15048 493 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 OLFM3Q96PB7 478 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 ZBTB18Q99592 522 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 TBC1D22BQ9NU19 505 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 LAMC1P11047 1609 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 KRT14P02533 472 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 FCER1AP12319 257 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 PALMDQ9NP74 551 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 PYGBP11216 843 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 SYNE4Q8N205 404 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 NCLNQ969V3 563 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1W2PQC6 194 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 MTRQ99707 1265 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 GNA15P30679 374 aa22.7■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 PPM1NQ8N819 430 aa22.7■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 USP6NLQ92738 828 aa22.7■■□□□ 1.23
PTPRM-211ENST00000580170 F5H423 210 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 ALX1Q15699 326 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 MAPK6Q16659 721 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 FSD1LQ9BXM9 530 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 CXorf56Q9H5V9 222 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 PCSK1NQ9UHG2 260 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 L3MBTL1Q9Y468 752 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 CPDO75976 1380 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 ASNSP08243 561 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 DRP2Q13474 957 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 FRA10AC1Q70Z53 315 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 ZBED8Q8IZ13 594 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 MYBL1P10243 752 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 MTF1Q14872 753 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 STXBP2Q15833 593 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms