RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 KIF11P52732 1056 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 SEC23AQ15436 765 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 TERF2Q15554 542 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 FIGNQ5HY92 759 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 PGM2L1Q6PCE3 622 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 CABP7Q86V35 215 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 SIRT2Q8IXJ6 389 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 ABI1Q8IZP0 508 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 ABHD4Q8TB40 342 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 RNF32Q9H0A6 362 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 MKS1Q9NXB0 559 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 ASH2LQ9UBL3 628 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 SIT1Q9Y3P8 196 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 BTAF1O14981 1849 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 SLC27A2O14975 620 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 CYBBP04839 570 aa6.88□□□□□ -1.31
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PTPRM-208ENST00000578600 SCAND1P57086 179 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 KCTD1Q719H9 257 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 C14orf80Q86SX3 495 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 RASSF3Q86WH2 238 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 AMOTL1Q8IY63 956 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 SLC13A1Q9BZW2 595 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 CD244Q9BZW8 370 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 ACSS2Q9NR19 701 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 GOLGA8AA7E2F4 631 aa6.87□□□□□ -1.31
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PTPRM-208ENST00000578600 RPS6KA4O75676 772 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 RFPL1O75677 317 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 ABLIM3O94929 683 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 CD40P25942 277 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 AFMP43652 599 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 PHC1P78364 1004 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 MLC1Q15049 377 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 ARTNQ5T4W7 220 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 GPR158Q5T848 1215 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 FAM102BQ5T8I3 360 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 FYB2Q5VWT5 728 aa6.87□□□□□ -1.31
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PTPRM-208ENST00000578600 CBLL1Q75N03 491 aa6.87□□□□□ -1.31
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PTPRM-208ENST00000578600 TCEAL8Q8IYN2 117 aa6.87□□□□□ -1.31
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PTPRM-208ENST00000578600 PALD1Q9ULE6 856 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 WNK3Q9BYP7 1800 aa6.87□□□□□ -1.31
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PTPRM-208ENST00000578600 LTFP02788 710 aa6.86□□□□□ -1.31
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PTPRM-208ENST00000578600 TTC8Q8TAM2 541 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 PEX11GQ96HA9 241 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 AP5M1Q9H0R1 490 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 MYOTQ9UBF9 498 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa6.86□□□□□ -1.31
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