RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576069.5

SPNS3-206, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS3, Length 834 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-206ENST00000576069 LRRC15Q8TF66 581 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 TMEM161AQ9NX61 479 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 MTMR10Q9NXD2 777 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 STK17AQ9UEE5 414 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 KCNG1Q9UIX4 513 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 PTPRSQ13332 1948 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 LCHNA4D1U4 455 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 HIP1RO75146 1068 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 KRT85P78386 507 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 TAP1Q03518 808 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 ARSHQ5FYA8 562 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 RRAGBQ5VZM2 374 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 DAW1Q8N136 415 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 BSNDQ8WZ55 320 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 POLD4Q9HCU8 107 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 TTC3P53804 2025 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 ERLIN2O94905 339 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 EOMESO95936 686 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 SKIP12755 728 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 MAPK7Q13164 816 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 FAM187BQ17R55 369 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 ECHDC2Q86YB7 292 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 PRIMPOLQ96LW4 560 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 FZD8Q9H461 694 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 PCDHA7Q9UN72 937 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 MYH15Q9Y2K3 1946 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 LINC01553A4QN01 128 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 TSPAN1O60635 241 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 ZNF623O75123 536 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 ME1P48163 572 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 EFNA5P52803 228 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 MCM6Q14566 821 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 AMHR2Q16671 573 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 DEPTORQ8TB45 409 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 FAM161BQ96MY7 647 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 HOXA2O43364 376 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 ARHGEF15O94989 841 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 RAB27AP51159 221 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 GRIN2CQ14957 1233 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 NAALADL2Q58DX5 795 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 SHC4Q6S5L8 630 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 GPBP1Q86WP2 473 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 CCDC51Q96ER9 411 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 ODF2LQ9ULJ1 636 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 NPTX2P47972 431 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 PEX3P56589 373 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 ERVK-21P61565 698 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 MAPK6Q16659 721 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 NOTUMQ6P988 496 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 SV2BQ7L1I2 683 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 FIBCD1Q8N539 461 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 SPIRE2Q8WWL2 714 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 SPATA32Q96LK8 384 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 GUCD1Q96NT3 240 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 SAMD11Q96NU1 681 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 PANK2Q9BZ23 570 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 FAM105AQ9NUU6 356 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 COL4A6Q14031 1691 aa21.4■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 GBF1Q92538 1859 aa21.39■■□□□ 1.02
SPNS3-206ENST00000576069 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS3-206ENST00000576069 CCDC169A6NNP5 214 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS3-206ENST00000576069 SFI1A8K8P3 1242 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS3-206ENST00000576069 PLS3P13797 630 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS3-206ENST00000576069 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SPNS3-206ENST00000576069 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SPNS3-206ENST00000576069 GIT2Q14161 759 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS3-206ENST00000576069 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SPNS3-206ENST00000576069 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SPNS3-206ENST00000576069 CCDC113Q9H0I3 377 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS3-206ENST00000576069 TMEM134Q9H6X4 195 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS3-206ENST00000576069 KMT5AQ9NQR1 393 aa21.39■■□□□ 1.01
SPNS3-206ENST00000576069 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SPNS3-206ENST00000576069 CHD7Q9P2D1 2997 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS3-206ENST00000576069 A0A087X0B3 334 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS3-206ENST00000576069 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS3-206ENST00000576069 A0A1B0GUA9 196 aa21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms