RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574728.1

PRPF8-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 466 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-211ENST00000574728 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 SP110Q9HB58 689 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 CNNM1Q9NRU3 951 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 IMPACTQ9P2X3 320 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 ACSL6Q9UKU0 697 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa5.88□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 NOTOA8MTQ0 251 aa5.87□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 ARNTLO00327 626 aa5.87□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 SASH1O94885 1247 aa5.87□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 GNAI2P04899 355 aa5.87□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 GNAI3P08754 354 aa5.87□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 LCP1P13796 627 aa5.87□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 PRKCAP17252 672 aa5.87□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 ADORA1P30542 326 aa5.87□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 GPR85P60893 370 aa5.87□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 TRIM61Q5EBN2 209 aa5.87□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 TAF7LQ5H9L4 462 aa5.87□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 TTLL5Q6EMB2 1281 aa5.87□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 KCNT2Q6UVM3 1135 aa5.87□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 NLRX1Q86UT6 975 aa5.87□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 CHAMP1Q96JM3 812 aa5.87□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 PLCD4Q9BRC7 762 aa5.87□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa5.87□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 NDOR1Q9UHB4 597 aa5.87□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 RCAN3Q9UKA8 241 aa5.87□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa5.87□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 HTTP42858 3142 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 A0A1W2PQJ5 194 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 RASSF10A6NK89 507 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 ADM5C9JUS6 153 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 H7C1D1 291 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 WNT10BO00744 389 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 SRGAP3O43295 1099 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 ARL4AP40617 200 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 IL15P40933 162 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 IRAK1P51617 712 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 CYP4F8P98187 520 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 ATP8B2P98198 1209 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 MVKQ03426 396 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 LSAMPQ13449 338 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 TIGD5Q53EQ6 642 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 METTL24Q5JXM2 366 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 CEP85Q6P2H3 762 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 ZNF804AQ7Z570 1209 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 LZTR1Q8N653 840 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 ZNF384Q8TF68 577 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 LPIN2Q92539 896 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 SIL1Q9H173 461 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 MYOZ2Q9NPC6 264 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 CRTAC1Q9NQ79 661 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 PDLIM7Q9NR12 457 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 GULP1Q9UBP9 304 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 JAG2Q9Y219 1238 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 TRAF6Q9Y4K3 522 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 SSC5DA1L4H1 1573 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 CNTNAP1P78357 1384 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 MYO3BQ8WXR4 1341 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 RFPL3O75679 317 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 PNLIPP16233 465 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 BCL6P41182 706 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 PHKA1P46020 1223 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 KCNJ4P48050 445 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 TFCP2Q12800 502 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 MVPQ14764 893 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 KIZQ2M2Z5 673 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 TKFCQ3LXA3 575 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 FYB2Q5VWT5 728 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 LBX2Q6XYB7 198 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 GSTCDQ8NEC7 633 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 USP33Q8TEY7 942 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 ALG1Q9BT22 464 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 RNF32Q9H0A6 362 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 GGA3Q9NZ52 723 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.471e-11■■□□□ 14.1
PRPF8-211ENST00000574728 MARCH2Q9P0N8 246 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 RWDD3Q9Y3V2 267 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 H7BY64 318 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 MSCO60682 206 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 FUCA1P04066 466 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 MSL3P1P0C860 447 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 TACR1P25103 407 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 MMP14P50281 582 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 TIMM10P62072 90 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 GUCY1A3Q02108 690 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF8-211ENST00000574728 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms