RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568810.5

PPP4C-213, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,080 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-213	ENST00000568810	ZNF558	Q96NG5	402 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PPP4C-213	ENST00000568810	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PPP4C-213	ENST00000568810	TLR9	Q9NR96	1032 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PPP4C-213	ENST00000568810	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PPP4C-213	ENST00000568810	ZNF623	O75123	536 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	LTBR	P36941	435 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	TEC	P42680	631 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	PLCB3	Q01970	1234 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	POU5F1B	Q06416	359 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	TFDP1	Q14186	410 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	27.63	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	ERMN	Q8TAM6	284 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	FAM50B	Q9Y247	325 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	IGFLR1	Q9H665	355 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	27.61	■■■□□ 2.01	4e-6	■□□□□ 10.3
PPP4C-213	ENST00000568810	PTEN	P60484	403 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	ADAM15	Q13444	863 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	PGBD4	Q96DM1	585 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	TMX3	Q96JJ7	454 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	ERLIN2	O94905	339 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	RPA1	P27694	616 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	ARL2	P36404	184 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	MCM2	P49736	904 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	KRT17	Q04695	432 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	EFHB	Q8N7U6	833 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	NACC1	Q96RE7	527 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	SPG21	Q9NZD8	308 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	FSD2	A1L4K1	749 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	CARNS1	A5YM72	827 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	MED24	O75448	989 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	IL9	P15248	144 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	MUT	P22033	750 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	NRIP1	P48552	1158 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	CAPS	Q13938	189 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	LPP	Q93052	612 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	LINC01565	O15544	149 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	TBX10	O75333	385 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	AXL	P30530	894 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	PBX3	P40426	434 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	ERVFC1	P60507	584 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	TLE6	Q9H808	572 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-213	ENST00000568810		A0A087WWV3	80 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4C-213	ENST00000568810	FSCN2	O14926	492 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4C-213	ENST00000568810	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
PPP4C-213	ENST00000568810	GLRA2	P23416	452 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4C-213	ENST00000568810	NDUFV1	P49821	464 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4C-213	ENST00000568810	NBR1	Q14596	966 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4C-213	ENST00000568810	LONRF3	Q496Y0	759 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4C-213	ENST00000568810	POTEG	Q6S5H5	508 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4C-213	ENST00000568810	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
PPP4C-213	ENST00000568810	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4C-213	ENST00000568810	CCDC51	Q96ER9	411 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4C-213	ENST00000568810	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
PPP4C-213	ENST00000568810	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
PPP4C-213	ENST00000568810	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
PPP4C-213	ENST00000568810	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-213	ENST00000568810	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-213	ENST00000568810	TSPAN1	O60635	241 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-213	ENST00000568810	OFD1	O75665	1012 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-213	ENST00000568810	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
PPP4C-213	ENST00000568810	BCAR1	P56945	870 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-213	ENST00000568810	UBXN11	Q5T124	520 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-213	ENST00000568810	NOTUM	Q6P988	496 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-213	ENST00000568810	CNNM3	Q8NE01	707 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-213	ENST00000568810	TCF25	Q9BQ70	676 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-213	ENST00000568810	RAB34	Q9BZG1	259 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-213	ENST00000568810	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-213	ENST00000568810	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-213	ENST00000568810	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		27.56	■■■□□ 2

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