RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567771.5

SPNS1-209, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 829 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-209ENST00000567771 SLC39A11Q8N1S5 342 aa28.45■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa28.45■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 FAM105AQ9NUU6 356 aa28.45■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 MEIS3P2A8K0S8 358 aa28.44■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 HIDE1A8MVS5 230 aa28.44■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa28.44■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 WNT7AO00755 349 aa28.44■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 SLITRK3O94933 977 aa28.44■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 XKR9Q5GH70 373 aa28.44■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 TPH2Q8IWU9 490 aa28.44■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
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SPNS1-209ENST00000567771 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa28.43■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 SKIP12755 728 aa28.43■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa28.43■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 KCNC3Q14003 757 aa28.43■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 EMC2Q15006 297 aa28.43■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 TMC7Q7Z402 723 aa28.43■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 MINDY3Q9H8M7 445 aa28.43■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 PCDHA12Q9UN75 941 aa28.43■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 FSD2A1L4K1 749 aa28.42■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF623O75123 536 aa28.42■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 RAB27AP51159 221 aa28.42■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 BCAR1P56945 870 aa28.42■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 CALCRLQ16602 461 aa28.42■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa28.42■■■□□ 2.14
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SPNS1-209ENST00000567771 PRR33A8MZF0 331 aa28.41■■■□□ 2.14
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SPNS1-209ENST00000567771 TRIM29Q14134 588 aa28.41■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 TCP11Q8WWU5 503 aa28.41■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 HSD17B14Q9BPX1 270 aa28.41■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa28.41■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 C5orf42Q9H799 3197 aa28.41■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 GAS2O43903 313 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
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SPNS1-209ENST00000567771 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa28.4■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 FERMT3Q86UX7 667 aa28.4■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 RNF135Q8IUD6 432 aa28.4■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 RNF149Q8NC42 400 aa28.4■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 MTRQ99707 1265 aa28.4■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa28.4■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 TBC1D13Q9NVG8 400 aa28.4■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa28.4■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa28.4■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 ASAP2O43150 1006 aa28.39■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 NEMFO60524 1076 aa28.39■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP28.39■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 TXKP42681 527 aa28.39■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 NOMO2Q5JPE7 1267 aa28.39■■■□□ 2.14
SPNS1-209ENST00000567771 LLGL2Q6P1M3 1020 aa28.39■■■□□ 2.14
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SPNS1-209ENST00000567771 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
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SPNS1-209ENST00000567771 LYPLA2O95372 231 aa28.38■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 TECP42680 631 aa28.38■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 ANKRD54Q6NXT1 300 aa28.38■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
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SPNS1-209ENST00000567771 TMEM169Q96HH4 297 aa28.38■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 MTMR9Q96QG7 549 aa28.38■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 C2orf71A6NGG8 1288 aa28.37■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 LOC730098B7Z3J9 87 aa28.37■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 SRGAP2BP0DMP2 458 aa28.37■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 PLA2G5P39877 138 aa28.37■■■□□ 2.13
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SPNS1-209ENST00000567771 FAM122AQ96E09 287 aa28.36■■■□□ 2.13
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SPNS1-209ENST00000567771 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa28.36■■■□□ 2.13
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SPNS1-209ENST00000567771 ATP2B1P20020 1258 aa28.35■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 CA8P35219 290 aa28.35■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF280BQ86YH2 543 aa28.35■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 VPS52Q8N1B4 723 aa28.35■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 IGSF21Q96ID5 467 aa28.35■■■□□ 2.13
SPNS1-209ENST00000567771 DNAJB4Q9UDY4 337 aa28.35■■■□□ 2.13
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