RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567264.1

UBFD1-208, Transcript of ubiquitin family domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene UBFD1, Length 642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBFD1-208ENST00000567264 LPIN1Q14693 890 aa25.03■■□□□ 1.6
UBFD1-208ENST00000567264 TMEM40Q8WWA1 233 aa25.03■■□□□ 1.6
UBFD1-208ENST00000567264 BADQ92934 168 aa25.03■■□□□ 1.6
UBFD1-208ENST00000567264 NUP62CLQ9H1M0 184 aa25.03■■□□□ 1.6
UBFD1-208ENST00000567264 CLSTN2Q9H4D0 955 aa25.03■■□□□ 1.6
UBFD1-208ENST00000567264 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
UBFD1-208ENST00000567264 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
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UBFD1-208ENST00000567264 SMARCE1Q969G3 411 aa25.02■■□□□ 1.6
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UBFD1-208ENST00000567264 TBC1D7Q9P0N9 293 aa25.02■■□□□ 1.6
UBFD1-208ENST00000567264 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa25.02■■□□□ 1.6
UBFD1-208ENST00000567264 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa25.02■■□□□ 1.6
UBFD1-208ENST00000567264 SIP14410 1827 aa25.02■■□□□ 1.6
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UBFD1-208ENST00000567264 GPR182O15218 404 aa25.01■■□□□ 1.59
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UBFD1-208ENST00000567264 DENND3A2RUS2 1198 aa25■■□□□ 1.59
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UBFD1-208ENST00000567264 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa25■■□□□ 1.59
UBFD1-208ENST00000567264 SEPT8Q92599 483 aa25■■□□□ 1.59
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UBFD1-208ENST00000567264 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa24.97■■□□□ 1.59
UBFD1-208ENST00000567264 DBF4BQ8NFT6 615 aa24.97■■□□□ 1.59
UBFD1-208ENST00000567264 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
UBFD1-208ENST00000567264 HVCN1Q96D96 273 aa24.97■■□□□ 1.59
UBFD1-208ENST00000567264 ACKR2O00590 384 aa24.96■■□□□ 1.59
UBFD1-208ENST00000567264 GTF2BQ00403 316 aa24.96■■□□□ 1.59
UBFD1-208ENST00000567264 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
UBFD1-208ENST00000567264 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
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