RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	BANK1	Q8NDB2	785 aa		19.93	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	LMO3	Q8TAP4	145 aa		19.93	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	HOOK2	Q96ED9	719 aa		19.93	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	ACCS	Q96QU6	501 aa		19.93	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	19.93	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	19.93	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	19.93	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	MAPK13	O15264	365 aa		19.93	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	HSD17B4	P51659	736 aa		19.93	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	19.93	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	DLGAP5	Q15398	846 aa		19.93	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	19.93	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		19.93	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	19.93	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	YDJC	A8MPS7	323 aa		19.92	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	19.92	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	CP	P00450	1065 aa		19.92	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	HSPA6	P17066	643 aa		19.92	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	VAMP7	P51809	220 aa		19.92	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	19.92	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		19.92	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		19.92	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	IWS1	Q96ST2	819 aa		19.92	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	THAP2	Q9H0W7	228 aa		19.92	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	FAM187A	A6NFU0	413 aa		19.91	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	GUCY1A3	Q02108	690 aa		19.91	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF844	Q08AG5	666 aa		19.91	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	19.91	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	PTGIS	Q16647	500 aa		19.91	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		19.91	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		19.91	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	19.91	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		19.91	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	OGFOD1	Q8N543	542 aa		19.91	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	RDH13	Q8NBN7	331 aa		19.91	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	19.91	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		19.91	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		19.91	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		19.91	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	19.91	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	PMM2	O15305	246 aa		19.91	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	APBA3	O96018	575 aa		19.91	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	ICAM1	P05362	532 aa		19.91	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	19.91	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		19.91	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		19.91	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		19.91	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		19.91	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	CENPH	Q9H3R5	247 aa		19.91	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		19.91	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	19.91	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	EMSY	Q7Z589	1322 aa		19.91	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		19.91	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		19.91	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	CLRN2	A0PK11	232 aa		19.9	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	LRRN2	O75325	713 aa		19.9	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	PLS3	P13797	630 aa		19.9	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	ITGB5	P18084	799 aa		19.9	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	19.9	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	DR1	Q01658	176 aa		19.9	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		19.9	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		19.9	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	MORC4	Q8TE76	937 aa		19.9	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		19.9	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		19.9	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	LYPLA2	O95372	231 aa		19.9	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	CHRNA5	P30532	468 aa		19.9	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	HSPA1L	P34931	641 aa		19.9	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	19.9	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		19.9	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		19.9	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	FMO2	Q99518	471 aa		19.9	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	ERP44	Q9BS26	406 aa		19.9	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		19.9	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		19.9	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		19.9	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		19.9	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	USP20	Q9Y2K6	914 aa		19.9	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	RPTOR	Q8N122	1335 aa		19.9	■□□□□ 0.78
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA0754	O94854	1291 aa		19.89	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	GBP1	P32455	592 aa		19.89	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	CAP2	P40123	477 aa		19.89	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	PTGER2	P43116	358 aa		19.89	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	19.89	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	19.89	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	GPC5	P78333	572 aa		19.89	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	EPC2	Q52LR7	807 aa		19.89	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	C3orf20	Q8ND61	904 aa		19.89	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	19.89	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		19.89	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	GGA2	Q9UJY4	613 aa		19.89	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		19.89	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	PSME4	Q14997	1843 aa		19.89	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	CNTNAP1	P78357	1384 aa		19.88	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	19.88	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	RTN2	O75298	545 aa		19.88	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	PPFIA2	O75334	1257 aa		19.88	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	19.88	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	19.88	■□□□□ 0.77
RRN3-205	ENST00000563559	RARRES1	P49788	294 aa		19.88	■□□□□ 0.77

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