RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560297.5

USP8-209, Transcript of ubiquitin specific peptidase 8, human

TSL 5

Gene USP8, Length 652 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP8-209	ENST00000560297	KCNN1	Q92952	543 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP8-209	ENST00000560297	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
USP8-209	ENST00000560297	GSDMA	Q96QA5	445 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP8-209	ENST00000560297	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP8-209	ENST00000560297	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
USP8-209	ENST00000560297	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP8-209	ENST00000560297	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP8-209	ENST00000560297	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
USP8-209	ENST00000560297	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
USP8-209	ENST00000560297	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
USP8-209	ENST00000560297	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	SLC16A4	O15374	487 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	NBN	O60934	754 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	GHR	P10912	638 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	CSF2RA	P15509	400 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	SYN1	P17600	705 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	CASP1	P29466	404 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	NCKAP1L	P55160	1127 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	FPGS	Q05932	587 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	COASY	Q13057	564 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	ALCAM	Q13740	583 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	LPIN1	Q14693	890 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	MBTPS1	Q14703	1052 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	KCNB1	Q14721	858 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	GPNMB	Q14956	572 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	MAPK6	Q16659	721 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	SFR1	Q86XK3	245 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	GPT2	Q8TD30	523 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	SEPT8	Q92599	483 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	APBB2	Q92870	758 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	SCLY	Q96I15	445 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	EXOC1	Q9NV70	894 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	RMND1	Q9NWS8	449 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	KLRC4	O43908	158 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	RHOBTB3	O94955	611 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	AXL	P30530	894 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	EHHADH	Q08426	723 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	STRN3	Q13033	797 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	PAK2	Q13177	524 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	PNOC	Q13519	176 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	FAM187B	Q17R55	369 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	SPATA20	Q8TB22	786 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	SMARCE1	Q969G3	411 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	FIZ1	Q96SL8	496 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	FZD8	Q9H461	694 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	IL23A	Q9NPF7	189 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	CHST12	Q9NRB3	414 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	PADI3	Q9ULW8	664 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	DENND3	A2RUS2	1198 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	ACKR2	O00590	384 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	ERLIN2	O94905	339 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	PRR29	P0C7W0	189 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	CD52	P31358	61 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	GTF2B	Q00403	316 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	CAMK4	Q16566	473 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	FAM228A	Q86W67	206 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	HVCN1	Q96D96	273 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	EVPL	Q92817	2033 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297		K7ENM7	598 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	EFCAB14	O75071	495 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP8-209	ENST00000560297	KIF20A	O95235	890 aa		13.49	□□□□□ -0.25

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