RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557657.5

TMEM260-216, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM260, Length 2,572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-216ENST00000557657 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 TRIM66O15016 1216 aa23■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 CCNE2O96020 404 aa23■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 ATP1A2P50993 1020 aa23■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 RUFY1Q96T51 708 aa23■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa23■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 PSME4Q14997 1843 aa23■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 TNFAIP3P21580 790 aa22.99■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 QARSP47897 775 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 HAUS6Q7Z4H7 955 aa22.99■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 IQCKQ8N0W5 287 aa22.99■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 OR2W6PQ8NHA6 318 aa22.99■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 ACTRT1Q8TDG2 376 aa22.99■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 SAAL1Q96ER3 474 aa22.99■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 PBKQ96KB5 322 aa22.99■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.99■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 KCND2Q9NZV8 630 aa22.99■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 PCNTO95613 3336 aa22.99■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 VAMP7P51809 220 aa22.99■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 PPP2R5AQ15172 486 aa22.99■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 CFAP58Q5T655 872 aa22.99■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 TEPSINQ96N21 525 aa22.99■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 ADRB2P07550 413 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 PGM5Q15124 567 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 HES6Q96HZ4 224 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 UBE4BO95155 1302 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 TTI1O43156 1089 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 FGGP02679 453 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 KRT13P13646 458 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 PLS3P13797 630 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 LMNB1P20700 586 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 MUTP22033 750 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 SP4Q02446 784 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 CPNE8Q86YQ8 564 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 TRIM31Q9BZY9 425 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 ANKRD63C9JTQ0 380 aa22.97■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 CALCAP01258 141 aa22.97■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 VCAM1P19320 739 aa22.97■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.97■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.97■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 CCDC127Q96BQ5 260 aa22.97■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 RMDN3Q96TC7 470 aa22.97■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa22.97■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 BCRP11274 1271 aa22.97■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 IRAK1P51617 712 aa22.97■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 ALS2CLQ60I27 953 aa22.97■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 SLC9A9Q8IVB4 645 aa22.97■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.97■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 RFFLQ8WZ73 363 aa22.97■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 AMFRQ9UKV5 643 aa22.97■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 DAPK3O43293 454 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 NNTQ13423 1086 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 XKR9Q5GH70 373 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 DPH5Q9H2P9 285 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 USP20Q9Y2K6 914 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 SGPL1O95470 568 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 TMEM253P0C7T8 217 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 ADSSP30520 456 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 MARCKSL1P49006 195 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 MAP3K10Q02779 954 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 PPATQ06203 517 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 ALG3Q92685 438 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 ATG4CQ96DT6 458 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 ACCSQ96QU6 501 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 AGPAT1Q99943 283 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 TRIM51Q9BSJ1 452 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 CCDC169A6NNP5 214 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 GOLGA8KD6RF30 607 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 OPA1O60313 960 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 RPS6KA5O75582 802 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 PDCLQ13371 301 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM260-216ENST00000557657 TNIP1Q15025 636 aa22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms