RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 ITIH3Q06033 890 aa9.14□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 GIT2Q14161 759 aa9.14□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 NOMO2Q5JPE7 1267 aa9.14□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 PPP4R3AQ6IN85 833 aa9.14□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 CES5AQ6NT32 575 aa9.14□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 ANO5Q75V66 913 aa9.14□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 OTUD6AQ7L8S5 288 aa9.14□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 NEK8Q86SG6 692 aa9.14□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 ZBTB33Q86T24 672 aa9.14□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 VPS52Q8N1B4 723 aa9.14□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 PGBD4Q96DM1 585 aa9.14□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 CEP170P1Q96L14 293 aa9.14□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 NLRP4Q96MN2 994 aa9.14□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 AIFM3Q96NN9 605 aa9.14□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 PHF20Q9BVI0 1012 aa9.14□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 FAM105AQ9NUU6 356 aa9.14□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 KCNJ14Q9UNX9 436 aa9.14□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 PPME1Q9Y570 386 aa9.14□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 NLRC5Q86WI3 1866 aa9.14□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 EML1O00423 815 aa9.13□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 TBX3O15119 743 aa9.13□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 ASAP2O43150 1006 aa9.13□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 SLC37A4O43826 429 aa9.13□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP9.13□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 BAG4O95429 457 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 RFC5P40937 340 aa9.13□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 NPEPPSP55786 919 aa9.13□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 NHLH1Q02575 133 aa9.13□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 SIGLEC14Q08ET2 396 aa9.13□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 PPP2R5CQ13362 524 aa9.13□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 EPHA7Q15375 998 aa9.13□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 NPY5RQ15761 445 aa9.13□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 LONRF3Q496Y0 759 aa9.13□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa9.13□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 KSR1Q8IVT5 923 aa9.13□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 FBXL6Q8N531 539 aa9.13□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 WASF1Q92558 559 aa9.13□□□□□ -0.95
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COCH-211ENST00000557065 IGSF21Q96ID5 467 aa9.13□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 NECTIN4Q96NY8 510 aa9.13□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 PRRX2Q99811 253 aa9.13□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 ADAM7Q9H2U9 754 aa9.13□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 KCNMB3Q9NPA1 279 aa9.13□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 KANSL3Q9P2N6 904 aa9.13□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 STK39Q9UEW8 545 aa9.13□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa9.13□□□□□ -0.95
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COCH-211ENST00000557065 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa9.13□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa9.13□□□□□ -0.95
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COCH-211ENST00000557065 MTHFRP42898 656 aa9.12□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 MRE11P49959 708 aa9.12□□□□□ -0.95
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COCH-211ENST00000557065 SCRN1Q12765 414 aa9.12□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 ANKRD1Q15327 319 aa9.12□□□□□ -0.95
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COCH-211ENST00000557065 PLA2G4FQ68DD2 849 aa9.12□□□□□ -0.95
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COCH-211ENST00000557065 C4orf19Q8IY42 314 aa9.12□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 SLFN12Q8IYM2 578 aa9.12□□□□□ -0.95
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COCH-211ENST00000557065 TCP11Q8WWU5 503 aa9.12□□□□□ -0.95
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COCH-211ENST00000557065 DCBLD2Q96PD2 775 aa9.12□□□□□ -0.95
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COCH-211ENST00000557065 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa9.12□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 TBC1D13Q9NVG8 400 aa9.12□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 VAV3Q9UKW4 847 aa9.12□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 TPCN1Q9ULQ1 816 aa9.12□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa9.12□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 IRAK3Q9Y616 596 aa9.12□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 GAS2O43903 313 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 CTSAP10619 480 aa9.11□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 SP100P23497 879 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 YWHABP31946 246 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 PTPN5P54829 565 aa9.11□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa9.11□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 PTPN21Q16825 1174 aa9.11□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 XKR9Q5GH70 373 aa9.11□□□□□ -0.95
COCH-211ENST00000557065 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
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