RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554292.1

PCNX1-206, Transcript of pecanex 1, human

TSL 4

Gene PCNX1, Length 402 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCNX1-206	ENST00000554292	AXL	P30530	894 aa		31.44	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	SLC12A3	P55017	1021 aa		31.44	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		31.44	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		31.44	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		31.44	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	STK17A	Q9UEE5	414 aa		31.44	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		31.44	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	SZT2	Q5T011	3432 aa		31.43	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	CUTA	O60888	179 aa		31.43	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	HIP1R	O75146	1068 aa		31.43	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	DGKI	O75912	1065 aa		31.43	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	RAB27A	P51159	221 aa		31.43	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	FAM189B	P81408	668 aa		31.43	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	31.43	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		31.43	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		31.43	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	RAD54L	Q92698	747 aa		31.43	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		31.43	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	31.42	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292		A0A0U1RQF3	1178 aa		31.42	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	LINC01553	A4QN01	128 aa		31.42	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	HOXA2	O43364	376 aa		31.42	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	USP49	Q70CQ1	688 aa		31.42	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	31.42	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	31.42	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	31.42	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		31.42	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	TCHH	Q07283	1943 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	KRT85	P78386	507 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	NUCB2	P80303	420 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	31.41	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	31.41	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	FIBCD1	Q8N539	461 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	BSND	Q8WZ55	320 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	31.41	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	CCDC51	Q96ER9	411 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	SAMD11	Q96NU1	681 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	31.41	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	EOMES	O95936	686 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	31.4	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	EFNA5	P52803	228 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	31.4	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	GRIN2C	Q14957	1233 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	NOTUM	Q6P988	496 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	GPBP1	Q86WP2	473 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	GUCD1	Q96NT3	240 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	TSPAN1	O60635	241 aa		31.39	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	ME1	P48163	572 aa		31.39	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	MAPK6	Q16659	721 aa		31.39	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		31.39	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	31.39	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		31.39	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		31.39	■■■□□ 2.62
PCNX1-206	ENST00000554292	ARHGEF15	O94989	841 aa		31.38	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	DDIT3	P35638	169 aa		31.38	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	31.38	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	ERVK-21	P61565	698 aa		31.38	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	31.38	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	MCM6	Q14566	821 aa		31.38	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	FAM187B	Q17R55	369 aa		31.38	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	DAW1	Q8N136	415 aa		31.38	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		31.38	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	31.38	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		31.38	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		31.38	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	31.37	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	31.37	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	STAT6	P42226	847 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	PEX3	P56589	373 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	MAPK7	Q13164	816 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	AMHR2	Q16671	573 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	ABI1	Q8IZP0	508 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	RNF169	Q8NCN4	708 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	CCDC169	A6NNP5	214 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	LRRC15	Q8TF66	581 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	PGBD4	Q96DM1	585 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	FZD8	Q9H461	694 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	POLD4	Q9HCU8	107 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	31.36	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	31.36	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		31.35	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	ZNF623	O75123	536 aa		31.35	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	PRKCB	P05771	671 aa		31.35	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	NPTX2	P47972	431 aa		31.35	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	SMTN	P53814	917 aa		31.35	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	31.35	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	CNNM3	Q8NE01	707 aa		31.35	■■■□□ 2.61
PCNX1-206	ENST00000554292	SPATA32	Q96LK8	384 aa		31.35	■■■□□ 2.61

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