RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552440.5

USP44-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 44, human

TSL 5 BASIC

Gene USP44, Length 1,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP44-208	ENST00000552440	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	PEX19	P40855	299 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	KCNJ6	P48051	423 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	IL2	P60568	153 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	CYP4F3	Q08477	520 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	STYK1	Q6J9G0	422 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	TBCB	Q99426	244 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	CHL1	O00533	1208 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	OFD1	O75665	1012 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	FKBP9	O95302	570 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	MYB	P10242	640 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	IDE	P14735	1019 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	PPP2R5D	Q14738	602 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	CCNG2	Q16589	344 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	KIF18B	Q86Y91	864 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	FIBCD1	Q8N539	461 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	ARL10	Q8N8L6	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	WNK4	Q96J92	1243 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	SGPP1	Q9BX95	441 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	VPS11	Q9H270	941 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	MKS1	Q9NXB0	559 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	EBF1	Q9UH73	591 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	PCDHGA12	O60330	932 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	SMARCA1	P28370	1054 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	PPM1A	P35813	382 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	PLIN5	Q00G26	463 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	CAP1	Q01518	475 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	NR1I3	Q14994	352 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	PLCB4	Q15147	1175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	LLGL1	Q15334	1064 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	USP53	Q70EK8	1073 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	RMDN3	Q96TC7	470 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	CDC23	Q9UJX2	597 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	POLH	Q9Y253	713 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		4.84	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	NOTO	A8MTQ0	251 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	AQP7	O14520	342 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	ULK1	O75385	1050 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	GYS1	P13807	737 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	PI3	P19957	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP44-208	ENST00000552440	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64

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