RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 PTPROQ16827 1216 aa23.19■■□□□ 1.3
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CS-222ENST00000550996 UBXN11Q5T124 520 aa23.19■■□□□ 1.3
CS-222ENST00000550996 DTHD1Q6ZMT9 781 aa23.19■■□□□ 1.3
CS-222ENST00000550996 SPPL3Q8TCT6 385 aa23.19■■□□□ 1.3
CS-222ENST00000550996 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
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CS-222ENST00000550996 P2RX5Q93086 422 aa23.19■■□□□ 1.3
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CS-222ENST00000550996 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
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CS-222ENST00000550996 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
CS-222ENST00000550996 ARHGEF35A5YM69 484 aa23.18■■□□□ 1.3
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CS-222ENST00000550996 EOMESO95936 686 aa23.18■■□□□ 1.3
CS-222ENST00000550996 CYP11B2P19099 503 aa23.18■■□□□ 1.3
CS-222ENST00000550996 POU5F1BQ06416 359 aa23.18■■□□□ 1.3
CS-222ENST00000550996 TCEAL5Q5H9L2 206 aa23.18■■□□□ 1.3
CS-222ENST00000550996 KCNK18Q7Z418 384 aa23.18■■□□□ 1.3
CS-222ENST00000550996 HELQQ8TDG4 1101 aa23.18■■□□□ 1.3
CS-222ENST00000550996 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
CS-222ENST00000550996 BHMT2Q9H2M3 363 aa23.18■■□□□ 1.3
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CS-222ENST00000550996 TIGD5Q53EQ6 642 aa23.17■■□□□ 1.3
CS-222ENST00000550996 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa23.17■■□□□ 1.3
CS-222ENST00000550996 MCPH1Q8NEM0 835 aa23.17■■□□□ 1.3
CS-222ENST00000550996 ASB2Q96Q27 587 aa23.17■■□□□ 1.3
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CS-222ENST00000550996 POLD4Q9HCU8 107 aa23.17■■□□□ 1.3
CS-222ENST00000550996 NCOR1O75376 2440 aa23.16■■□□□ 1.3
CS-222ENST00000550996 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa23.16■■□□□ 1.3
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CS-222ENST00000550996 SYT1P21579 422 aa23.16■■□□□ 1.3
CS-222ENST00000550996 PBX3P40426 434 aa23.16■■□□□ 1.3
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CS-222ENST00000550996 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
CS-222ENST00000550996 BRAPQ7Z569 592 aa23.16■■□□□ 1.3
CS-222ENST00000550996 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa23.16■■□□□ 1.3
CS-222ENST00000550996 VWA3AA6NCI4 1184 aa23.15■■□□□ 1.3
CS-222ENST00000550996 E9PMD0 336 aa23.15■■□□□ 1.3
CS-222ENST00000550996 B4GALT5O43286 388 aa23.15■■□□□ 1.3
CS-222ENST00000550996 IRS1P35568 1242 aa23.15■■□□□ 1.3
CS-222ENST00000550996 RESTQ13127 1097 aa23.15■■□□□ 1.3
CS-222ENST00000550996 KRT79Q5XKE5 535 aa23.15■■□□□ 1.3
CS-222ENST00000550996 ABI1Q8IZP0 508 aa23.15■■□□□ 1.3
CS-222ENST00000550996 LRRC43Q8N309 656 aa23.15■■□□□ 1.3
CS-222ENST00000550996 HLA-CQ95604 372 aa23.15■■□□□ 1.3
CS-222ENST00000550996 SNX21Q969T3 373 aa23.15■■□□□ 1.3
CS-222ENST00000550996 CPB2Q96IY4 423 aa23.15■■□□□ 1.3
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CS-222ENST00000550996 BDP1A6H8Y1 2624 aa23.15■■□□□ 1.3
CS-222ENST00000550996 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa23.15■■□□□ 1.3
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CS-222ENST00000550996 GRIN1Q05586 938 aa23.14■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 COL19A1Q14993 1142 aa23.14■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
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CS-222ENST00000550996 POF1BQ8WVV4 589 aa23.14■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
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CS-222ENST00000550996 STK24Q9Y6E0 443 aa23.14■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 LRRIQ4A6NIV6 560 aa23.13■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 TTLL13PA6NNM8 815 aa23.13■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 FGF18O76093 207 aa23.13■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 ERLIN2O94905 339 aa23.13■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 EYA4O95677 639 aa23.13■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 LAG3P18627 525 aa23.13■■□□□ 1.29
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CS-222ENST00000550996 FAM173BQ6P4H8 233 aa23.13■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 RUSC1Q9BVN2 902 aa23.13■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 MTMR6Q9Y217 621 aa23.13■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 B4GALT3O60512 393 aa23.12■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 OFD1O75665 1012 aa23.12■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 EDN1P05305 212 aa23.12■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 SKIP12755 728 aa23.12■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 HYAL1Q12794 435 aa23.12■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.296e-13■□□□□ 9.5
CS-222ENST00000550996 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 KCNT2Q6UVM3 1135 aa23.12■■□□□ 1.29
CS-222ENST00000550996 DAW1Q8N136 415 aa23.12■■□□□ 1.29
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