RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 OSBPL7Q9BZF2 842 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 CCDC113Q9H0I3 377 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 RBSNQ9H1K0 784 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 ADAMTS10Q9H324 1103 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 KCTD10Q9H3F6 313 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 C17orf75Q9HAS0 396 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 IFT122Q9HBG6 1241 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 KMT5AQ9NQR1 393 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 AKT3Q9Y243 479 aa8.98□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 DENND3A2RUS2 1198 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP8.97□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 TGFB1I1O43294 461 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 CTSHP09668 335 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 GNAT1P11488 350 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 EN2P19622 333 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 ZNF165P49910 485 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 DNM2P50570 870 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 PTENP60484 403 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 KIZQ2M2Z5 673 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 TTI2Q6NXR4 508 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 SLC39A4Q6P5W5 647 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 LUZP1Q86V48 1076 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 FAM126BQ8IXS8 530 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 EXOC8Q8IYI6 725 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 MYOCDQ8IZQ8 938 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 AOPEPQ8N6M6 819 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 DEPTORQ8TB45 409 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 TMEM40Q8WWA1 233 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 IFT74Q96LB3 600 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 MAP7D2Q96T17 732 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 OSMRQ99650 979 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 HSD3B7Q9H2F3 369 aa8.97□□□□□ -0.97
CS-216ENST00000549221 ANKRD63C9JTQ0 380 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 B4GALT5O43286 388 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 CD4P01730 458 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 CHRNA1P02708 482 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 FGFR4P22455 802 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 CCNE1P24864 410 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 TMOD1P28289 359 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 MBTD1Q05BQ5 628 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 MGAT3Q09327 533 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 PAK1Q13153 545 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 SNX17Q15036 470 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 PPP2R5AQ15172 486 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 AMHR2Q16671 573 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 TRIM60Q495X7 471 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 ANKRD40Q6AI12 368 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 CENPPQ6IPU0 288 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 TAF2Q6P1X5 1199 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 MAP4K3Q8IVH8 894 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 NLRP7Q8WX94 980 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 KCNN1Q92952 543 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 P2RX5Q93086 422 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 EEF2KMTQ96G04 330 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 TBX20Q9UMR3 447 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 GINS2Q9Y248 185 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 CDY2AQ9Y6F7 541 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 UBE4BO95155 1302 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa8.96□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 FSD2A1L4K1 749 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 PSMA7O14818 248 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 ASAP2O43150 1006 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 PRKCBP05771 671 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 ADSSP30520 456 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 THPOP40225 353 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 SMTNP53814 917 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 POU5F1BQ06416 359 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 PTK7Q13308 1070 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 TFDP1Q14186 410 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 LRRC26Q2I0M4 334 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 LRRC55Q6ZSA7 311 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 RPAINQ86UA6 219 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 ZNF410Q86VK4 478 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 ANKLE1Q8NAG6 615 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 FAM200AQ8TCP9 573 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 HVCN1Q96D96 273 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 ACCSQ96QU6 501 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-216ENST00000549221 BPIFA3Q9BQP9 254 aa8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms