RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545264.1

CCDC82-208, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC82, Length 557 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-208ENST00000545264 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CCDC82-208ENST00000545264 KRT40Q6A162 431 aa6.54□□□□□ -1.36
CCDC82-208ENST00000545264 IQSEC1Q6DN90 963 aa6.54□□□□□ -1.36
CCDC82-208ENST00000545264 GGNQ86UU5 652 aa6.54□□□□□ -1.36
CCDC82-208ENST00000545264 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa6.54□□□□□ -1.36
CCDC82-208ENST00000545264 GAB3Q8WWW8 586 aa6.54□□□□□ -1.36
CCDC82-208ENST00000545264 UIMC1Q96RL1 719 aa6.54□□□□□ -1.36
CCDC82-208ENST00000545264 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CCDC82-208ENST00000545264 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
CCDC82-208ENST00000545264 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.54□□□□□ -1.36
CCDC82-208ENST00000545264 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.54□□□□□ -1.36
CCDC82-208ENST00000545264 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CCDC82-208ENST00000545264 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.53□□□□□ -1.36
CCDC82-208ENST00000545264 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CCDC82-208ENST00000545264 NRG3P56975 720 aa6.53□□□□□ -1.36
CCDC82-208ENST00000545264 ADAM8P78325 824 aa6.53□□□□□ -1.36
CCDC82-208ENST00000545264 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
CCDC82-208ENST00000545264 GRM7Q14831 915 aa6.53□□□□□ -1.36
CCDC82-208ENST00000545264 PDCD1Q15116 288 aa6.53□□□□□ -1.36
CCDC82-208ENST00000545264 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.53□□□□□ -1.36
CCDC82-208ENST00000545264 ATL2Q8NHH9 583 aa6.53□□□□□ -1.36
CCDC82-208ENST00000545264 ACAP3Q96P50 834 aa6.53□□□□□ -1.36
CCDC82-208ENST00000545264 GPHA2Q96T91 129 aa6.53□□□□□ -1.36
CCDC82-208ENST00000545264 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
CCDC82-208ENST00000545264 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.53□□□□□ -1.36
CCDC82-208ENST00000545264 MUSKO15146 869 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 GPR39O43194 453 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 GAAP10253 952 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 KIR2DL3P43628 341 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 FAPQ12884 760 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 FOXL1Q12952 345 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 CT83Q5H943 113 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 LMBR1LQ6UX01 489 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 GLB1L2Q8IW92 636 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 OR14C36Q8NHC7 312 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 WDR66Q8TBY9 1149 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 FAM89AQ96GI7 184 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 TMEM176AQ96HP8 235 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 ADOQ96SZ5 270 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 PRSS50Q9UI38 385 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 MTSS1O43312 755 aa6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 LY86O95711 162 aa6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 CD69Q07108 199 aa6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 CDSNQ15517 529 aa6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 UGT8Q16880 541 aa6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 GAREM2Q75VX8 874 aa6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 PALM2Q8IXS6 379 aa6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 PRDM12Q9H4Q4 367 aa6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 IL23AQ9NPF7 189 aa6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 MCM8Q9UJA3 840 aa6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 RCAN3Q9UKA8 241 aa6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 LPLP06858 475 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 ENPP1P22413 925 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 LGALS4P56470 323 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 HHEXQ03014 270 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 MGAT5Q09328 741 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 Q6ZSN1 163 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 D2HGDHQ8N465 521 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 EDAQ92838 391 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 TCF25Q9BQ70 676 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 NCDNQ9UBB6 729 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 CDY2AQ9Y6F7 541 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 UBE2QL1A1L167 161 aa6.49□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 GOLGA8AA7E2F4 631 aa6.49□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 ALDH1A2O94788 518 aa6.49□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 INSRRP14616 1297 aa6.49□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 SPIDRQ14159 915 aa6.49□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.49□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.49□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 RAX2Q96IS3 184 aa6.49□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.49□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 VTA1Q9NP79 307 aa6.49□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 ING3Q9NXR8 418 aa6.49□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.49□□□□□ -1.37
CCDC82-208ENST00000545264 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms