RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543123.1

RTN3-212, Transcript of reticulon 3, humanhuman

TSL 2

Gene RTN3, Length 712 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN3-212ENST00000543123 STK39Q9UEW8 545 aa14.66□□□□□ -0.06
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RTN3-212ENST00000543123 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa14.66□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 PER2O15055 1255 aa14.65□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 NEMFO60524 1076 aa14.65□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 ZNF623O75123 536 aa14.65□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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RTN3-212ENST00000543123 BCAR1P56945 870 aa14.65□□□□□ -0.06
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RTN3-212ENST00000543123 NR5A1Q13285 461 aa14.65□□□□□ -0.06
RTN3-212ENST00000543123 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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RTN3-212ENST00000543123 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.061e-11■■■□□ 14.6
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RTN3-212ENST00000543123 CALCRLQ16602 461 aa14.65□□□□□ -0.06
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RTN3-212ENST00000543123 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RTN3-212ENST00000543123 NOMO2Q5JPE7 1267 aa14.64□□□□□ -0.07
RTN3-212ENST00000543123 RNF135Q8IUD6 432 aa14.64□□□□□ -0.07
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RTN3-212ENST00000543123 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
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RTN3-212ENST00000543123 TBC1D13Q9NVG8 400 aa14.62□□□□□ -0.07
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RTN3-212ENST00000543123 ARID2Q68CP9 1835 aa14.62□□□□□ -0.07
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RTN3-212ENST00000543123 C2orf71A6NGG8 1288 aa14.61□□□□□ -0.07
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RTN3-212ENST00000543123 SLITRK3O94933 977 aa14.61□□□□□ -0.07
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RTN3-212ENST00000543123 NOTUMQ6P988 496 aa14.61□□□□□ -0.07
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RTN3-212ENST00000543123 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
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