RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527157.1

KDM2A-208, Transcript of lysine demethylase 2A, human

TSL 2

Gene KDM2A, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KDM2A-208	ENST00000527157	FGD4	Q96M96	766 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	KATNBL1	Q9H079	304 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	RIPK3	Q9Y572	518 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	C5orf42	Q9H799	3197 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	KIF28P	B7ZC32	967 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	IGSF3	O75054	1194 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	PHACTR2	O75167	634 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	CABYR	O75952	493 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	FAM13A	O94988	1023 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	CYP2D6	P10635	497 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	CYP2C9	P11712	490 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	ACTN1	P12814	892 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	AKR1B1	P15121	316 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	TNFAIP2	Q03169	654 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	ZNF385B	Q569K4	471 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	PRSS33	Q8NF86	280 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	CCDC120	Q96HB5	630 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	SWAP70	Q9UH65	585 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	BAIAP3	O94812	1187 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	GNAI3	P08754	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	RFC2	P35250	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	CPXCR1	Q8N123	301 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	GPR108	Q9NPR9	543 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	TNKS	O95271	1327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	PTPRS	Q13332	1948 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	TRANK1	O15050	2925 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	TTC28	Q96AY4	2481 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157		E9PSI1	815 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	ATP2A1	O14983	1001 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	ZEB2	O60315	1214 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	ABL1	P00519	1130 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	IQCF3	P0C7M6	154 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	KCNJ6	P48051	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	DEFB103A	P81534	67 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	CNTN2	Q02246	1040 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	LCORL	Q8N3X6	602 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	NEK9	Q8TD19	979 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	CCDC17	Q96LX7	622 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KDM2A-208	ENST00000527157	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms