RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525711.1

UBASH3B-202, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-202ENST00000525711 DOCK8Q8NF50 2099 aa16■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 LMNAP02545 664 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 FGFR4P22455 802 aa16■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 KLRC2P26717 231 aa16■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 PRKCEQ02156 737 aa16■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 LETM2Q2VYF4 491 aa16■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa16■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa16■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa16■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 TRAIPQ9BWF2 469 aa16■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 C22orf23Q9BZE7 217 aa16■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 TBC1D13Q9NVG8 400 aa16■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 FRYLO94915 3013 aa16■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 GALTP07902 379 aa15.99■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 RBM25P49756 843 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 RAB27AP51159 221 aa15.99■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 PTPN14Q15678 1187 aa15.99■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 PRR16Q569H4 304 aa15.99■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 NOMO2Q5JPE7 1267 aa15.99■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 RUFY3Q7L099 469 aa15.99■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 URGCPQ8TCY9 931 aa15.99■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 GBP3Q9H0R5 595 aa15.99■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa15.99■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 C6orf50Q9HD87 102 aa15.99■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 DISC1Q9NRI5 854 aa15.99■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 DPP7Q9UHL4 492 aa15.99■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 BRPF3Q9ULD4 1205 aa15.99■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa15.99■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 GOLGA8AA7E2F4 631 aa15.98■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 GOLGA8BA8MQT2 603 aa15.98■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 RPS6KB1P23443 525 aa15.98■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 DNM2P50570 870 aa15.98■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 CLCN4P51793 760 aa15.98■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa15.98■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 STAMQ92783 540 aa15.98■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 LPPQ93052 612 aa15.98■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 PGBD4Q96DM1 585 aa15.98■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 HINFPQ9BQA5 517 aa15.98■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 FAM105AQ9NUU6 356 aa15.98■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 WNT16Q9UBV4 365 aa15.98■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa15.98■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 MYH15Q9Y2K3 1946 aa15.98■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 ESYT2A0FGR8 921 aa15.97■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF862O60290 1169 aa15.97■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 CFHP08603 1231 aa15.97■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 GNA11P29992 359 aa15.97■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 SFNP31947 248 aa15.97■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 LONRF3Q496Y0 759 aa15.97■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 KLHL5Q96PQ7 755 aa15.97■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 AGXT2Q9BYV1 514 aa15.97■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 ADAMTS3O15072 1205 aa15.96■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 GAS7O60861 476 aa15.96■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 CNPP09543 421 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC11A1P49279 550 aa15.96■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 JAK3P52333 1124 aa15.96■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 CYP26C1Q6V0L0 522 aa15.96■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF410Q86VK4 478 aa15.96■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 BICD2Q8TD16 824 aa15.96■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 NXPE3Q969Y0 559 aa15.96■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 RMDN1Q96DB5 314 aa15.96■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 ZMYND12Q9H0C1 365 aa15.96■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 MAN1C1Q9NR34 630 aa15.96■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 DNAJB4Q9UDY4 337 aa15.96■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa15.96■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
UBASH3B-202ENST00000525711 A0A087WZ62 844 aa15.95■□□□□ 0.14
UBASH3B-202ENST00000525711 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa15.95■□□□□ 0.14
UBASH3B-202ENST00000525711 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa15.95■□□□□ 0.14
UBASH3B-202ENST00000525711 CHMP2AO43633 222 aa15.95■□□□□ 0.14
UBASH3B-202ENST00000525711 NARSO43776 548 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF623O75123 536 aa15.95■□□□□ 0.14
UBASH3B-202ENST00000525711 OFD1O75665 1012 aa15.95■□□□□ 0.14
UBASH3B-202ENST00000525711 URODP06132 367 aa15.95■□□□□ 0.14
UBASH3B-202ENST00000525711 ADH1AP07327 375 aa15.95■□□□□ 0.14
UBASH3B-202ENST00000525711 CDC27P30260 824 aa15.95■□□□□ 0.14
UBASH3B-202ENST00000525711 CIITAP33076 1130 aa15.95■□□□□ 0.14
UBASH3B-202ENST00000525711 RCAN1P53805 252 aa15.95■□□□□ 0.14
UBASH3B-202ENST00000525711 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
UBASH3B-202ENST00000525711 MTERF2Q49AM1 385 aa15.95■□□□□ 0.14
UBASH3B-202ENST00000525711 CATSPER4Q7RTX7 472 aa15.95■□□□□ 0.14
UBASH3B-202ENST00000525711 KIAA2013Q8IYS2 634 aa15.95■□□□□ 0.14
UBASH3B-202ENST00000525711 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms