RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 ASAP2O43150 1006 aa25.03■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 STX17P56962 302 aa25.03■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 PTENP60484 403 aa25.03■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 TFDP1Q14186 410 aa25.03■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF618Q5T7W0 954 aa25.03■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa25.03■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 STRA6Q9BX79 667 aa25.03■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 UMODL1Q5DID0 1318 aa25.03■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 KAT6AQ92794 2004 aa25.03■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 PPP1R37O75864 691 aa25.02■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa25.02■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 MYOCDQ8IZQ8 938 aa25.02■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 ADSSL1Q8N142 457 aa25.02■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 ANO10Q9NW15 660 aa25.02■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 TBX20Q9UMR3 447 aa25.02■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 CKBP12277 381 aa25.02■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 PMS1P54277 932 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 RSPH3Q86UC2 560 aa25.02■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 NME8Q8N427 588 aa25.02■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 CTNND2Q9UQB3 1225 aa25.02■■□□□ 1.6
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIM49BA6NDI0 452 aa25.01■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 DCDC2CA8MYV0 355 aa25.01■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 K7ERI5 159 aa25.01■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 B4GALT5O43286 388 aa25.01■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 GTF2BQ00403 316 aa25.01■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 MBTD1Q05BQ5 628 aa25.01■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 LRSAM1Q6UWE0 723 aa25.01■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 EEF2KMTQ96G04 330 aa25.01■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 MED15Q96RN5 788 aa25.01■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa25.01■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 PHKA2P46019 1235 aa25■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF445P59923 1031 aa25■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 TNS4Q8IZW8 715 aa25■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 MLKLQ8NB16 471 aa25■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF507Q8TCN5 953 aa25■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 SEMA6BQ9H3T3 888 aa25■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 MGAT3Q09327 533 aa25■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa25■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa25■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC113Q9H0I3 377 aa25■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 TRPV2Q9Y5S1 764 aa25■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 MROH7Q68CQ1 1323 aa24.99■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 C1orf53Q5VUE5 145 aa24.99■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 TRAF7Q6Q0C0 670 aa24.99■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF410Q86VK4 478 aa24.99■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 GAS2L3Q86XJ1 694 aa24.99■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 NELFBQ8WX92 580 aa24.99■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa24.99■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 M0QZ92 97 aa24.98■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 TLR3O15455 904 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 DARSP14868 501 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 RPAINQ86UA6 219 aa24.98■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa24.98■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa24.98■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 PRKCBP05771 671 aa24.98■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 SYCP3Q8IZU3 236 aa24.98■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 TOX2Q96NM4 488 aa24.98■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 TSPY26PQ9H489 355 aa24.98■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKRD63C9JTQ0 380 aa24.97■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP24.97■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 GHRP10912 638 aa24.97■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 CCL23P55773 120 aa24.97■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 MBTPS1Q14703 1052 aa24.97■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 MAPK6Q16659 721 aa24.97■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 CPB2Q96IY4 423 aa24.97■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 ACCSQ96QU6 501 aa24.97■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 C2orf40Q9H1Z8 148 aa24.97■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 KCTD10Q9H3F6 313 aa24.97■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM39AQ9NV64 488 aa24.97■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 TGFB1I1O43294 461 aa24.96■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 CYP2C18P33260 490 aa24.96■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 EFNA5P52803 228 aa24.96■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 STRN3Q13033 797 aa24.96■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 AMHR2Q16671 573 aa24.96■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 BMT2Q1RMZ1 405 aa24.96■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKRD40Q6AI12 368 aa24.96■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 MAP4K3Q8IVH8 894 aa24.96■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 RNF214Q8ND24 703 aa24.96■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 BICD1Q96G01 975 aa24.96■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 HIPK3Q9H422 1215 aa24.96■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 FZD8Q9H461 694 aa24.96■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 CLIC2O15247 247 aa24.96■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 POU5F1BQ06416 359 aa24.96■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 STIM1Q13586 685 aa24.96■■□□□ 1.59
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC39A4Q6P5W5 647 aa24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms