RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517351.5

TCEA1-202, Transcript of transcription elongation factor A1, humanhuman

TSL 4

Gene TCEA1, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1-202ENST00000517351 CLLU1OSQ5K130 101 aa28.41■■■□□ 2.14
TCEA1-202ENST00000517351 HSCBQ8IWL3 235 aa28.41■■■□□ 2.14
TCEA1-202ENST00000517351 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
TCEA1-202ENST00000517351 AAASQ9NRG9 546 aa28.41■■■□□ 2.14
TCEA1-202ENST00000517351 HCSTQ9UBK5 93 aa28.41■■■□□ 2.14
TCEA1-202ENST00000517351 LRRIQ4A6NIV6 560 aa28.4■■■□□ 2.14
TCEA1-202ENST00000517351 BMP15O95972 392 aa28.4■■■□□ 2.14
TCEA1-202ENST00000517351 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
TCEA1-202ENST00000517351 NAALADL2Q58DX5 795 aa28.4■■■□□ 2.14
TCEA1-202ENST00000517351 KLHL23Q8NBE8 558 aa28.4■■■□□ 2.14
TCEA1-202ENST00000517351 HELQQ8TDG4 1101 aa28.4■■■□□ 2.14
TCEA1-202ENST00000517351 NFKBIZQ9BYH8 718 aa28.4■■■□□ 2.14
TCEA1-202ENST00000517351 LMAN2LQ9H0V9 348 aa28.4■■■□□ 2.14
TCEA1-202ENST00000517351 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
TCEA1-202ENST00000517351 PLAGL2Q9UPG8 496 aa28.4■■■□□ 2.14
TCEA1-202ENST00000517351 DNM3Q9UQ16 869 aa28.4■■■□□ 2.14
TCEA1-202ENST00000517351 E9PMD0 336 aa28.39■■■□□ 2.14
TCEA1-202ENST00000517351 EYA4O95677 639 aa28.39■■■□□ 2.14
TCEA1-202ENST00000517351 MBTD1Q05BQ5 628 aa28.39■■■□□ 2.14
TCEA1-202ENST00000517351 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
TCEA1-202ENST00000517351 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
TCEA1-202ENST00000517351 TIGD5Q53EQ6 642 aa28.39■■■□□ 2.14
TCEA1-202ENST00000517351 LRRC43Q8N309 656 aa28.39■■■□□ 2.14
TCEA1-202ENST00000517351 CWH43Q9H720 699 aa28.39■■■□□ 2.14
TCEA1-202ENST00000517351 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa28.39■■■□□ 2.14
TCEA1-202ENST00000517351 TSPAN1O60635 241 aa28.38■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 ZNF623O75123 536 aa28.38■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 ITGB1P05556 798 aa28.38■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 AXLP30530 894 aa28.38■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 RESTQ13127 1097 aa28.38■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 LONRF3Q496Y0 759 aa28.38■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 LPPQ93052 612 aa28.38■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa28.38■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 LAG3P18627 525 aa28.37■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 LRRC55Q6ZSA7 311 aa28.37■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa28.37■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 BSNDQ8WZ55 320 aa28.37■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 MTMR6Q9Y217 621 aa28.37■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 EYSQ5T1H1 3165 aa28.37■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 AMHR2Q16671 573 aa28.36■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 HYIQ5T013 277 aa28.36■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 UBXN11Q5T124 520 aa28.36■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 NOTUMQ6P988 496 aa28.36■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 KCNK18Q7Z418 384 aa28.36■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa28.36■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 SPPL3Q8TCT6 385 aa28.36■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 PGBD4Q96DM1 585 aa28.36■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 CPB2Q96IY4 423 aa28.36■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa28.36■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 AK8Q96MA6 479 aa28.36■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 MEIS3P2A8K0S8 358 aa28.35■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 STX6O43752 255 aa28.35■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 CSPG5O95196 566 aa28.35■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 PPP2R5AQ15172 486 aa28.35■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 CCDC51Q96ER9 411 aa28.35■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 PNMA5Q96PV4 448 aa28.35■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 PLIN2Q99541 437 aa28.35■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 NT5C3AQ9H0P0 336 aa28.35■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 POLD4Q9HCU8 107 aa28.35■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 COG5Q9UP83 839 aa28.35■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 NAMPTP43490 491 aa28.34■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa28.34■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 TCEAL5Q5H9L2 206 aa28.34■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 FAM173BQ6P4H8 233 aa28.34■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 GLB1LQ6UWU2 654 aa28.34■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 CABP7Q86V35 215 aa28.34■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 THNSL1Q8IYQ7 743 aa28.34■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 POF1BQ8WVV4 589 aa28.34■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 RSPH1Q8WYR4 309 aa28.34■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 KIFAP3Q92845 792 aa28.34■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 HLA-CQ95604 372 aa28.34■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 C2orf40Q9H1Z8 148 aa28.34■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 CLIC4Q9Y696 253 aa28.34■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 B4GALT5O43286 388 aa28.33■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 DNAJB1P25685 340 aa28.33■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 CAMK1Q14012 370 aa28.33■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 KCTD17Q8N5Z5 321 aa28.33■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 CNNM3Q8NE01 707 aa28.33■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 DEPTORQ8TB45 409 aa28.33■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 IFT74Q96LB3 600 aa28.33■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 ZNF558Q96NG5 402 aa28.33■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 CSRNP2Q9H175 543 aa28.33■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa28.33■■■□□ 2.13
TCEA1-202ENST00000517351 FGF18O76093 207 aa28.32■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 UBA7P41226 1012 aa28.32■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 TFF2Q03403 129 aa28.32■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 TJAP1Q5JTD0 557 aa28.32■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 RINT1Q6NUQ1 792 aa28.32■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 KCNT2Q6UVM3 1135 aa28.32■■■□□ 2.12
TCEA1-202ENST00000517351 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms