RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515854.5

ATP2C1-223, Transcript of ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1, human

TSL 4

Gene ATP2C1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP2C1-223	ENST00000515854	METTL7B	Q6UX53	244 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	KSR1	Q8IVT5	923 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	TTC13	Q8NBP0	860 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	BAP1	Q92560	729 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	KIFAP3	Q92845	792 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	HVCN1	Q96D96	273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	PCYT2	Q99447	389 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	CHP1	Q99653	195 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	PTPN18	Q99952	460 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	PORCN	Q9H237	461 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	EFCC1	Q9HA90	598 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	AAAS	Q9NRG9	546 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	WBP1L	Q9NX94	342 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	PPME1	Q9Y570	386 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	FAM187A	A6NFU0	413 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854		H0YCG3	227 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	EPHB6	O15197	1021 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	MAPK13	O15264	365 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLC16A4	O15374	487 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	MAP3K7	O43318	606 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	SORBS3	O60504	671 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	NOL4	O94818	638 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	NDUFA10	O95299	355 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	CCDC175	P0C221	793 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	SCP2	P22307	547 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	ABCD1	P33897	745 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	ARL2	P36404	184 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	RFC5	P40937	340 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	NPTX2	P47972	431 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	STAT5B	P51692	787 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	SMTN	P53814	917 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	SP4	Q02446	784 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	PPP2R5A	Q15172	486 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	LY6K	Q17RY6	165 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	MTERF2	Q49AM1	385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	WDR78	Q5VTH9	848 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	PDXDC1	Q6P996	788 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	NEK11	Q8NG66	645 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	BSND	Q8WZ55	320 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLC35C1	Q96A29	364 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	GPR20	Q99678	358 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	DESI2	Q9BSY9	194 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	GAN	Q9H2C0	597 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	VTA1	Q9NP79	307 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2C1-223	ENST00000515854	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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