RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 IGFALSP35858 605 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 MIIPQ5JXC2 388 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 WDR48Q8TAF3 677 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF503Q96F45 646 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 C16orf92Q96LL3 132 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 SAMD15Q9P1V8 674 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 VWA7Q9Y334 891 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 RFPL3O75679 317 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 PRLP01236 227 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 STAT5BP51692 787 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 FOXL1Q12952 345 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF460Q14592 562 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM260Q9NX78 707 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 ATF3P18847 181 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 SDSP20132 328 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 MEOX1P50221 254 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 FOXE3Q13461 319 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 CREB3L3Q68CJ9 461 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 OR14A2Q96R54 314 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 ORAI3Q9BRQ5 295 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 CSRNP2Q9H175 543 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 NELFAQ9H3P2 528 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 ACSS2Q9NR19 701 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 FAM83GA6ND36 823 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 CBX4O00257 560 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 SLC26A4O43511 780 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 RGS3P49796 1198 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 ADCY7P51828 1080 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 KIF11P52732 1056 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 ANTXR2P58335 489 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 SH3TC2Q8TF17 1288 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 EXTL1Q92935 676 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 MAML3Q96JK9 1138 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 HAPLN2Q9GZV7 340 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-217ENST00000509355 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 MAP3K1Q13233 1512 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 ADAM8P78325 824 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
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PDE4D-217ENST00000509355 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 CCNB3Q8WWL7 1395 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 PTPDC1A2A3K4 754 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 C2orf78A6NCI8 922 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 CYP17A1P05093 508 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 SLC6A3Q01959 620 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 MAP3K12Q12852 859 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 IL17DQ8TAD2 202 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 RABGGTAQ92696 567 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 LPPQ93052 612 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
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PDE4D-217ENST00000509355 FAM89AQ96GI7 184 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 PCED1AQ9H1Q7 454 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 NCOA2Q15596 1464 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 CCDC18Q5T9S5 1454 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 ADGBQ8N7X0 1667 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 ABCC3O15438 1527 aa6.76□□□□□ -1.33
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PDE4D-217ENST00000509355 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
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PDE4D-217ENST00000509355 KRT37O76014 449 aa6.75□□□□□ -1.33
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PDE4D-217ENST00000509355 ADAM15Q13444 863 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 GRM7Q14831 915 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 EPHA7Q15375 998 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 CCDC144BQ3MJ40 725 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-217ENST00000509355 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.75□□□□□ -1.33
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