RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	HAS1	Q92839	578 aa		5.51	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	POFUT1	Q9H488	388 aa		5.51	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	MTG2	Q9H4K7	406 aa		5.51	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	CABP5	Q9NP86	173 aa		5.51	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	OXSM	Q9NWU1	459 aa		5.51	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	HK1	P19367	917 aa		5.5	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	SPIDR	Q14159	915 aa		5.5	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		5.5	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	ZNF276	Q8N554	614 aa		5.5	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		5.5	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		5.5	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	COL4A3	Q01955	1670 aa		5.5	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	OPHN1	O60890	802 aa		5.49	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	MFAP3L	O75121	409 aa		5.49	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	GAA	P10253	952 aa		5.49	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	SOGA3	Q5TF21	947 aa		5.49	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	ST8SIA2	Q92186	375 aa		5.49	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	ARL8A	Q96BM9	186 aa		5.49	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		5.49	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	ZMAT4	Q9H898	229 aa		5.49	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	TOMM22	Q9NS69	142 aa		5.49	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		5.49	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	LCHN	A4D1U4	455 aa		5.48	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	FAM83G	A6ND36	823 aa		5.48	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	BMP5	P22003	454 aa		5.48	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	NPEPPS	P55786	919 aa		5.48	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	CD69	Q07108	199 aa		5.48	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		5.48	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	CFAP100	Q494V2	611 aa		5.48	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	MFSD5	Q6N075	450 aa		5.48	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		5.48	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	NME9	Q86XW9	330 aa		5.48	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		5.48	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	NXPE1	Q8N323	547 aa		5.48	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		5.48	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	LENG9	Q96B70	501 aa		5.48	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		5.48	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		5.48	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		5.48	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		5.47	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		5.47	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	PCDH8	O95206	1070 aa		5.47	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	ASMTL	O95671	621 aa		5.47	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	GC	P02774	474 aa		5.47	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	PTGS2	P35354	604 aa		5.47	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	ADCY1	Q08828	1119 aa		5.47	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	5.47	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	C7orf31	Q8N865	590 aa		5.47	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		5.47	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	MTFR1L	Q9H019	292 aa		5.47	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
USP34-222	ENST00000498268	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	AHRR	A9YTQ3	701 aa		5.46	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	TGM5	O43548	720 aa		5.46	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	ADRA1B	P35368	520 aa		5.46	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	CASR	P41180	1078 aa		5.46	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	FAM189B	P81408	668 aa		5.46	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		5.46	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	UIMC1	Q96RL1	719 aa		5.46	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		5.46	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	5.46	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		5.46	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	FZD1	Q9UP38	647 aa		5.46	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		5.46	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	MYPN	Q86TC9	1320 aa		5.46	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	MTSS1	O43312	755 aa		5.45	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	ALDH1A2	O94788	518 aa		5.45	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	GNAT2	P19087	354 aa		5.45	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	CSRP2	Q16527	193 aa		5.45	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		5.45	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		5.45	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		5.45	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		5.45	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		5.44	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	LPXN	O60711	386 aa		5.44	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	FSBP	O95073	299 aa		5.44	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	LY86	O95711	162 aa		5.44	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		5.44	□□□□□ -1.54
USP34-222	ENST00000498268	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54

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