RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495705.5

LMO4-204, Transcript of LIM domain only 4, humanhuman

TSL 3

Gene LMO4, Length 565 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4-204ENST00000495705 E2F4Q16254 413 aa22.15■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 SLC24A5Q71RS6 500 aa22.15■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 TOP1MTQ969P6 601 aa22.15■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 REEP2Q9BRK0 252 aa22.15■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.15■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa22.15■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.14■■□□□ 1.14
LMO4-204ENST00000495705 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 CMA1P23946 247 aa22.14■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 AXLP30530 894 aa22.14■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 EFNA5P52803 228 aa22.14■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 PEX3P56589 373 aa22.14■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.14■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.14■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 PBX4Q9BYU1 374 aa22.14■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.14■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.14■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 POLD4Q9HCU8 107 aa22.14■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 MSRAQ9UJ68 235 aa22.14■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 A0A1W2PQ27 194 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 A0A1W2PQ64 194 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 A0A1W2PQD8 194 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 C9IYK1 514 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 FAM13AO94988 1023 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 STAG3L1P0CL83 205 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 PLS3P13797 630 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 DNAJB2P25686 324 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 SMTNP53814 917 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 DHX58Q96C10 678 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 TRAIPQ9BWF2 469 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 TNMDQ9H2S6 317 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.13■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.12■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 TLL1O43897 1013 aa22.12■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 TSPAN1O60635 241 aa22.12■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 NPTX2P47972 431 aa22.12■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 GIT2Q14161 759 aa22.12■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 MAPK6Q16659 721 aa22.12■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 FAM187BQ17R55 369 aa22.12■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 GPR153Q6NV75 609 aa22.12■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.12■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 CCDC51Q96ER9 411 aa22.12■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 LRCH3Q96II8 777 aa22.12■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 RAD9AQ99638 391 aa22.12■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 PARVGQ9HBI0 331 aa22.12■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 KMT5AQ9NQR1 393 aa22.12■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 COL4A6Q14031 1691 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 TMEM265A0A087WTH1 108 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 CCDC169A6NNP5 214 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 SFI1A8K8P3 1242 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 UPP2O95045 317 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 PFKFB1P16118 471 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 RAB27AP51159 221 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 ZNF131P52739 623 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 RABGGTBP53611 331 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 AMPD3Q01432 767 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 AMHR2Q16671 573 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 DDX12PQ92771 950 aa22.11■■□□□ 1.13
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LMO4-204ENST00000495705 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 FZD8Q9H461 694 aa22.11■■□□□ 1.13
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LMO4-204ENST00000495705 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.11■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 INSL6Q9Y581 213 aa22.11■■□□□ 1.13
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LMO4-204ENST00000495705 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.1■■□□□ 1.13
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LMO4-204ENST00000495705 H0YCG3 227 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 PRKCBP05771 671 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 SKIP12755 728 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 SCP2P22307 547 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 PBX2P40425 430 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 FAM189BP81408 668 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 NOTUMQ6P988 496 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 CRIPAKQ8N1N5 446 aa22.1■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LMO4-204ENST00000495705 TIFAQ96CG3 184 aa22.1■■□□□ 1.13
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