RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495354.1

ARF4-208, Transcript of ADP ribosylation factor 4, human

TSL 3

Gene ARF4, Length 495 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARF4-208	ENST00000495354	PSMC5	P62195	406 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARF4-208	ENST00000495354	NTRK3	Q16288	839 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARF4-208	ENST00000495354	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARF4-208	ENST00000495354	NLRP4	Q96MN2	994 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARF4-208	ENST00000495354	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ARF4-208	ENST00000495354	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ARF4-208	ENST00000495354	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARF4-208	ENST00000495354	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARF4-208	ENST00000495354	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ARF4-208	ENST00000495354	DPP7	Q9UHL4	492 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARF4-208	ENST00000495354	C5orf42	Q9H799	3197 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ARF4-208	ENST00000495354	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	PROB1	E7EW31	1015 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	BRD1	O95696	1058 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	CYP3A7	P24462	503 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	BLID	Q8IZY5	108 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	ADAMTS3	O15072	1205 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	GALT	P07902	379 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	CPA1	P15085	419 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	EVC	P57679	992 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	DRP2	Q13474	957 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	13.63	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	13.63	□□□□□ -0.23	6e-9	■■■□□ 15
ARF4-208	ENST00000495354	PTPN14	Q15678	1187 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	CNNM3	Q8NE01	707 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	TCP11	Q8WWU5	503 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	SNX27	Q96L92	541 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	RSAD1	Q9HA92	442 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354		H0Y858	1186 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	OFD1	O75665	1012 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	TDP2	O95551	362 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	UROD	P06132	367 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	EPCAM	P16422	314 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	XBP1	P17861	261 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	CLCN5	P51795	746 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	FOXK2	Q01167	660 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	STAM	Q92783	540 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	LPP	Q93052	612 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	FAM20A	Q96MK3	541 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	MBOAT7	Q96N66	472 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	CEP89	Q96ST8	783 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	GBP3	Q9H0R5	595 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	CDH22	Q9UJ99	828 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	CDKL5	O76039	1030 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	ERLIN2	O94905	339 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	ALDH2	P05091	517 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	ASGR2	P07307	311 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	KLRC2	P26717	231 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	RFC5	P40937	340 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	NBL1	P41271	181 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	SLC11A1	P49279	550 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	PPP2R5C	Q13362	524 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	ANO5	Q75V66	913 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	GPR149	Q86SP6	731 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	CEP170P1	Q96L14	293 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ARF4-208	ENST00000495354	CACNA1H	O95180	2353 aa		13.61	□□□□□ -0.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms