RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 KIFC3Q9BVG8 833 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-213ENST00000492657 AP1M1Q9BXS5 423 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-213ENST00000492657 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
PRAME-213ENST00000492657 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
PRAME-213ENST00000492657 NFU1Q9UMS0 254 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-213ENST00000492657 KCNA4P22459 653 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-213ENST00000492657 MAGEA9P43362 315 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-213ENST00000492657 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
PRAME-213ENST00000492657 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
PRAME-213ENST00000492657 HAUS6Q7Z4H7 955 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-213ENST00000492657 VPS36Q86VN1 386 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-213ENST00000492657 ARHGEF19Q8IW93 802 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-213ENST00000492657 MICALL2Q8IY33 904 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-213ENST00000492657 METTL13Q8N6R0 699 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-213ENST00000492657 USP38Q8NB14 1042 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-213ENST00000492657 NEK9Q8TD19 979 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-213ENST00000492657 KAT5Q92993 513 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-213ENST00000492657 PDCD2LQ9BRP1 358 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-213ENST00000492657 APEX2Q9UBZ4 518 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-213ENST00000492657 HACL1Q9UJ83 578 aa13.96□□□□□ -0.17
PRAME-213ENST00000492657 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
PRAME-213ENST00000492657 PLS3P13797 630 aa13.96□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 C1orf220Q5T0J3 134 aa13.96□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 RNF207Q6ZRF8 634 aa13.96□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 NIPA1Q7RTP0 329 aa13.96□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 SLC9A9Q8IVB4 645 aa13.96□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 ELMO3Q96BJ8 720 aa13.96□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 VPS33BQ9H267 617 aa13.96□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 RNF14Q9UBS8 474 aa13.96□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 GOLGA6BA6NDN3 693 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 RAD51CO43502 376 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 PPP2R5AQ15172 486 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 XKR9Q5GH70 373 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 FAM102BQ5T8I3 360 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 DAAM2Q86T65 1068 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 SLC20A1Q8WUM9 679 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 ARHGEF26Q96DR7 871 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 ACCSQ96QU6 501 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 SYT11Q9BT88 431 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 PXMP2Q9NR77 195 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 KRT13P13646 458 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 VAMP7P51809 220 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 GUCY2FP51841 1108 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 ARHGEF16Q5VV41 709 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 FBXW10Q5XX13 1052 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 PEX26Q7Z412 305 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 KAT2BQ92831 832 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 HSPBP1Q9NZL4 362 aa13.95□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 ANKRD63C9JTQ0 380 aa13.94□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 VWA5AO00534 786 aa13.94□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 ZBED4O75132 1171 aa13.94□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 ITGA4P13612 1032 aa13.94□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 SP4Q02446 784 aa13.94□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 GHRHRQ02643 423 aa13.94□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 EP400NLQ6ZTU2 488 aa13.94□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 SLC35G2Q8TBE7 412 aa13.94□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 GDF3Q9NR23 364 aa13.94□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 RNF146Q9NTX7 359 aa13.94□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 TNFAIP3P21580 790 aa13.94□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 CCT5P48643 541 aa13.94□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 EPHB4P54760 987 aa13.94□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 SLFN11Q7Z7L1 901 aa13.94□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 FAM84AQ96KN4 292 aa13.94□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 ACP6Q9NPH0 428 aa13.94□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 TBC1D22BQ9NU19 505 aa13.94□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa13.94□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 CCDC169A6NNP5 214 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 ADRB2P07550 413 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 TNFAIP1Q13829 316 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 NT5DC3Q86UY8 548 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 IFT20Q8IY31 132 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 SAAL1Q96ER3 474 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 TMEM59LQ9UK28 342 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 LMNB1P20700 586 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 USP8P40818 1118 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 BAG6P46379 1132 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 CORO7P57737 925 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 ANO5Q75V66 913 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP13.93□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 CBWD2Q8IUF1 395 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 XXYLT1Q8NBI6 393 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 CCDC127Q96BQ5 260 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 THAP2Q9H0W7 228 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 TMEM206Q9H813 350 aa13.93□□□□□ -0.18
PRAME-213ENST00000492657 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82 ms