RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 PGS1Q32NB8 556 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRC-212ENST00000491302 PHF19Q5T6S3 580 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM200BQ69YZ2 307 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRC-212ENST00000491302 PRR23BQ6ZRT6 265 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRC-212ENST00000491302 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRC-212ENST00000491302 NBPF11Q86T75 865 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRC-212ENST00000491302 STK32CQ86UX6 486 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRC-212ENST00000491302 IGDCC3Q8IVU1 814 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRC-212ENST00000491302 SAMD3Q8N6K7 520 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRC-212ENST00000491302 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRC-212ENST00000491302 PJA1Q8NG27 643 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRC-212ENST00000491302 NRG4Q8WWG1 115 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRC-212ENST00000491302 RPS6KC1Q96S38 1066 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRC-212ENST00000491302 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRC-212ENST00000491302 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRC-212ENST00000491302 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRC-212ENST00000491302 SCOCQ9UIL1 159 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC154A6NI56 674 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRC-212ENST00000491302 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRC-212ENST00000491302 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRC-212ENST00000491302 FSBPO95073 299 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRC-212ENST00000491302 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRC-212ENST00000491302 PPP4R3AQ6IN85 833 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRC-212ENST00000491302 CAMKK1Q8N5S9 505 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRC-212ENST00000491302 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRC-212ENST00000491302 PMM1Q92871 262 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRC-212ENST00000491302 SYT3Q9BQG1 590 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRC-212ENST00000491302 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP9.78□□□□□ -0.84
PTPRC-212ENST00000491302 FAM171A2A8MVW0 826 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 H3BML4 177 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 KNG1P01042 644 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 ANTXR2P58335 489 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 MGAT5Q09328 741 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 MIGA2Q7L4E1 593 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 SVIPQ8NHG7 77 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 ZBTB8AQ96BR9 441 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 INTUQ9ULD6 942 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 PTPN22Q9Y2R2 807 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 IPPQ9Y573 584 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 PLEKHD1A6NEE1 506 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 ADCY8P40145 1251 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 PICALMQ13492 652 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP9.76□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 SYCP2LQ5T4T6 812 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 C11orf96Q7Z7L8 435 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 DENND1CQ8IV53 801 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 IFNL2Q8IZJ0 200 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 FAM43AQ8N2R8 423 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 ZBTB34Q8NCN2 500 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 GPR156Q8NFN8 814 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 WDR92Q96MX6 357 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 SOX7Q9BT81 388 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP9.76□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 ANO9A1A5B4 782 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 PHF2O75151 1096 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 MGAT2Q10469 447 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 COBLL1Q53SF7 1204 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 MORC4Q8TE76 937 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 NOX5Q96PH1 765 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 USP25Q9UHP3 1055 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC10BA6NIK2 292 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 HRGP04196 525 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 EDNRBP24530 442 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 POLD1P28340 1107 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 IL12RB1P42701 662 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 IRAK1P51617 712 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 EPHB3P54753 998 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 RTP5Q14D33 572 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 MLANAQ16655 118 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 C7orf25Q9BPX7 421 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 MYH16Q9H6N6 1097 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 KMT5AQ9NQR1 393 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 DNAI1Q9UI46 699 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 VWA7Q9Y334 891 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 COMMD10Q9Y6G5 202 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRC-212ENST00000491302 ZBED1O96006 694 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 USP14P54578 494 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 NOMO1Q15155 1222 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 CYB5RLQ6IPT4 315 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 UNC5BQ8IZJ1 945 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRC-212ENST00000491302 KCNN1Q92952 543 aa9.73□□□□□ -0.85
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