RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 KIF2CQ99661 725 aa18.22■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 C7orf25Q9BPX7 421 aa18.22■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 ZMYND12Q9H0C1 365 aa18.22■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 IP6K2Q9UHH9 426 aa18.22■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 KCNH4Q9UQ05 1017 aa18.22■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 TTI1O43156 1089 aa18.22■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 GNA15P30679 374 aa18.22■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 TAP1Q03518 808 aa18.22■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 IQCB1Q15051 598 aa18.22■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 C6orf118Q5T5N4 469 aa18.22■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 ELMOD1Q8N336 334 aa18.22■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 SEPT1Q8WYJ6 367 aa18.22■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 ATP6V1E2Q96A05 226 aa18.22■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 MYOZ2Q9NPC6 264 aa18.22■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 PREX1Q8TCU6 1659 aa18.22■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 KRT7P08729 469 aa18.22■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa18.22■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 AP1M1Q9BXS5 423 aa18.22■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 ZMYND10O75800 440 aa18.22■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 ADCY2Q08462 1091 aa18.22■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 KATNAL1Q9BW62 490 aa18.22■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 DBN1Q16643 649 aa18.22■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 MMEL1Q495T6 779 aa18.22■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 CYP26B1Q9NR63 512 aa18.22■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 STK38LQ9Y2H1 464 aa18.22■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 NR3C2P08235 984 aa18.21■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 PAMP19021 973 aa18.21■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 CHST13Q8NET6 341 aa18.21■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 OR6J1Q8NGC5 347 aa18.21■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 BAG5Q9UL15 447 aa18.21■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 CAPN7Q9Y6W3 813 aa18.21■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 LLGL1Q15334 1064 aa18.21■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 STXBP3O00186 592 aa18.21■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 MAGEB2O15479 319 aa18.21■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 VPS39Q96JC1 886 aa18.21■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 RIT2Q99578 217 aa18.21■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 C11orf70Q9BRQ4 267 aa18.21■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa18.21■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 ARL4CP56559 192 aa18.21■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 JADE1Q6IE81 842 aa18.21■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 SAAL1Q96ER3 474 aa18.21■□□□□ 0.51
NISCH-213ENST00000489895 M0QYV0 167 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP18.2■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 GGA3Q9NZ52 723 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 EMSYQ7Z589 1322 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 FAF2Q96CS3 445 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 UBN1Q9NPG3 1134 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 GGPS1O95749 300 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 MYCP01106 439 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 PRKCBP05771 671 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 SCP2P22307 547 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 SEPT6Q14141 434 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 SCN4BQ8IWT1 228 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 RNF149Q8NC42 400 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 GH1P01241 217 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 SOX5P35711 763 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 RFC5P40937 340 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 IFNAR2P48551 515 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 ACAP3Q96P50 834 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 GRID2IPA4D2P6 1211 aa18.19■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 ASAP2O43150 1006 aa18.19■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 DPEP1P16444 411 aa18.19■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 ANTXR2P58335 489 aa18.19■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 TNIP3Q96KP6 325 aa18.19■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 TUBB6Q9BUF5 446 aa18.19■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 RGL1Q9NZL6 768 aa18.19■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 ITSN1Q15811 1721 aa18.19■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 NNTQ13423 1086 aa18.19■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 MCUQ8NE86 351 aa18.19■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 VCX3AQ9NNX9 186 aa18.19■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 KRT37O76014 449 aa18.19■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 PMLP29590 882 aa18.19■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 CASP8Q14790 479 aa18.19■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 KLC3Q6P597 504 aa18.19■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 NUP85Q9BW27 656 aa18.19■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 WNT8AQ9H1J5 351 aa18.19■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 FAN1Q9Y2M0 1017 aa18.19■□□□□ 0.5
NISCH-213ENST00000489895 TTC26A0AVF1 554 aa18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms