RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GADL1Q6ZQY3 521 aa16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GANQ9H2C0 597 aa16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa16.86■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM153BP0C7A2 387 aa16.85■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CORO7P57737 925 aa16.85■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SP2Q02086 613 aa16.85■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC18A3Q16572 532 aa16.85■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM153CQ494X1 144 aa16.85■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DCAF15Q66K64 600 aa16.85■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC31Q6UY01 552 aa16.85■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MMGT1Q8N4V1 131 aa16.85■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SH2D3CQ8N5H7 860 aa16.85■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC127Q96BQ5 260 aa16.85■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IQCDQ96DY2 449 aa16.85■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CENPHQ9H3R5 247 aa16.85■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM153AQ9UHL3 310 aa16.85■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa16.85■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FRMPD4Q14CM0 1322 aa16.85■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa16.85■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDXKO00764 312 aa16.85■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 QARSP47897 775 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SETQ01105 290 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCNX4Q63HM2 1172 aa16.85■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 B3GNT9Q6UX72 402 aa16.85■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MCF2L2Q86YR7 1114 aa16.85■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AP1M1Q9BXS5 423 aa16.85■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SSC5DA1L4H1 1573 aa16.84■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF862O60290 1169 aa16.84■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LCA5LO95447 670 aa16.84■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRT14P02533 472 aa16.84■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 P4HBP07237 508 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GCLMP48507 274 aa16.84■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP1A2P50993 1020 aa16.84■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM76AQ8TAV0 307 aa16.84■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PSD3Q9NYI0 1048 aa16.84■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 USP2O75604 605 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GSCP56915 257 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EDRF1Q3B7T1 1238 aa16.84■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBXW10Q5XX13 1052 aa16.84■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANO5Q75V66 913 aa16.84■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BSNDQ8WZ55 320 aa16.84■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KAT5Q92993 513 aa16.84■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARL8AQ96BM9 186 aa16.84■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZBTB10Q96DT7 871 aa16.84■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VPS33BQ9H267 617 aa16.84■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD2APQ9Y5K6 639 aa16.84■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPTORQ8N122 1335 aa16.84■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 USP8P40818 1118 aa16.83■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP16.83■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPAINQ86UA6 219 aa16.83■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.29
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CEP104O60308 925 aa16.83■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLA2G6O60733 806 aa16.83■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GNA14O95837 355 aa16.83■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PGK2P07205 417 aa16.83■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM63BQ5T3F8 832 aa16.83■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TAF4BQ92750 862 aa16.83■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VIPAS39Q9H9C1 493 aa16.83■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa16.83■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GRID2IPA4D2P6 1211 aa16.83■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PJA2O43164 708 aa16.83■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NAB2Q15742 525 aa16.83■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RIT2Q99578 217 aa16.83■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF408Q9H9D4 720 aa16.83■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD63C9JTQ0 380 aa16.82■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IRF6O14896 467 aa16.82■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABCB4P21439 1286 aa16.82■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DSG3P32926 999 aa16.82■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP16.82■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRAF1Q13077 416 aa16.82■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTERF2Q49AM1 385 aa16.82■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HS2ST1Q7LGA3 356 aa16.82■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NLRX1Q86UT6 975 aa16.82■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PALB2Q86YC2 1186 aa16.82■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD35Q8N283 1001 aa16.82■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SIX2Q9NPC8 291 aa16.82■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OLFML3Q9NRN5 406 aa16.82■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMOD4Q9NZQ9 345 aa16.82■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NAA35Q5VZE5 725 aa16.82■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa16.82■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NCAPG2Q86XI2 1143 aa16.82■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 REPS2Q8NFH8 660 aa16.82■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLEKHO2Q8TD55 490 aa16.82■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KAT2BQ92831 832 aa16.82■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SGSM3Q96HU1 749 aa16.82■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CEP170P1Q96L14 293 aa16.82■□□□□ 0.28
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BTBD7Q9P203 1132 aa16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms