RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488279.6

PTPN4-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 5

Gene PTPN4, Length 662 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-211ENST00000488279 XKR9Q5GH70 373 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPN4-211ENST00000488279 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PTPN4-211ENST00000488279 TCP11Q8WWU5 503 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPN4-211ENST00000488279 C11orf16Q9NQ32 467 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPN4-211ENST00000488279 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PTPN4-211ENST00000488279 FAM86C2PA6NEL3 165 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPN4-211ENST00000488279 ASAP2O43150 1006 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPN4-211ENST00000488279 GLP2RO95838 553 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPN4-211ENST00000488279 FOSBP53539 338 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPN4-211ENST00000488279 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPN4-211ENST00000488279 PLPP4Q5VZY2 271 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPN4-211ENST00000488279 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPN4-211ENST00000488279 SMRP1Q8NCR6 262 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPN4-211ENST00000488279 FAM105AQ9NUU6 356 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPN4-211ENST00000488279 ZBTB39O15060 712 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPN4-211ENST00000488279 DCXO43602 365 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPN4-211ENST00000488279 ZNF623O75123 536 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPN4-211ENST00000488279 RAB27AP51159 221 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPN4-211ENST00000488279 GLB1LQ6UWU2 654 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPN4-211ENST00000488279 TMC7Q7Z402 723 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPN4-211ENST00000488279 LPPQ93052 612 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPN4-211ENST00000488279 HSD17B14Q9BPX1 270 aa25.23■■□□□ 1.63
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PTPN4-211ENST00000488279 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
PTPN4-211ENST00000488279 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPN4-211ENST00000488279 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa25.23■■□□□ 1.63
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PTPN4-211ENST00000488279 BCAR1P56945 870 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPN4-211ENST00000488279 EMC2Q15006 297 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPN4-211ENST00000488279 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.63
PTPN4-211ENST00000488279 LONRF3Q496Y0 759 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPN4-211ENST00000488279 SLC39A11Q8N1S5 342 aa25.22■■□□□ 1.63
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PTPN4-211ENST00000488279 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa25.21■■□□□ 1.63
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PTPN4-211ENST00000488279 TXKP42681 527 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPN4-211ENST00000488279 FERMT3Q86UX7 667 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPN4-211ENST00000488279 RNF149Q8NC42 400 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPN4-211ENST00000488279 MTRQ99707 1265 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPN4-211ENST00000488279 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPN4-211ENST00000488279 HIDE1A8MVS5 230 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPN4-211ENST00000488279 LYPLA2O95372 231 aa25.2■■□□□ 1.62
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PTPN4-211ENST00000488279 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa25.2■■□□□ 1.62
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PTPN4-211ENST00000488279 VN1R2Q8NFZ6 395 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPN4-211ENST00000488279 TMEM169Q96HH4 297 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPN4-211ENST00000488279 MTMR9Q96QG7 549 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPN4-211ENST00000488279 MINDY3Q9H8M7 445 aa25.2■■□□□ 1.62
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PTPN4-211ENST00000488279 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa25.2■■□□□ 1.62
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PTPN4-211ENST00000488279 GUCY1B3Q02153 619 aa25.17■■□□□ 1.62
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PTPN4-211ENST00000488279 MCM7P33993 719 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPN4-211ENST00000488279 PTENP60484 403 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPN4-211ENST00000488279 ANKRD54Q6NXT1 300 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPN4-211ENST00000488279 VPS52Q8N1B4 723 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPN4-211ENST00000488279 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PTPN4-211ENST00000488279 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPN4-211ENST00000488279 KANSL3Q9P2N6 904 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPN4-211ENST00000488279 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
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