RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487269.1

FAM204A-208, Transcript of family with sequence similarity 204 member A, human

TSL 2

Gene FAM204A, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM204A-208	ENST00000487269	EOMES	O95936	686 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM204A-208	ENST00000487269	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	13.34	□□□□□ -0.27
FAM204A-208	ENST00000487269	TEC	P42680	631 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM204A-208	ENST00000487269	DNM2	P50570	870 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM204A-208	ENST00000487269	CYP4A11	Q02928	519 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM204A-208	ENST00000487269	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
FAM204A-208	ENST00000487269	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM204A-208	ENST00000487269	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM204A-208	ENST00000487269	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM204A-208	ENST00000487269	TMC7	Q7Z402	723 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM204A-208	ENST00000487269	ZNF410	Q86VK4	478 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM204A-208	ENST00000487269	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM204A-208	ENST00000487269	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
FAM204A-208	ENST00000487269	DYDC2	Q96IM9	177 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM204A-208	ENST00000487269	CEP170P1	Q96L14	293 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM204A-208	ENST00000487269	LXN	Q9BS40	222 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM204A-208	ENST00000487269	CHST12	Q9NRB3	414 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM204A-208	ENST00000487269	DACT1	Q9NYF0	836 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM204A-208	ENST00000487269	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
FAM204A-208	ENST00000487269	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM204A-208	ENST00000487269	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FAM204A-208	ENST00000487269	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	JAK2	O60674	1132 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	13.33	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	PPM1A	P35813	382 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	KRT17	Q04695	432 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	ST3GAL1	Q11201	340 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	EPHA7	Q15375	998 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	SPOCK2	Q92563	424 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269		A0A087WWV3	80 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	OFD1	O75665	1012 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	SEC24B	O95487	1268 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	NEFL	P07196	543 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	CDC42EP1	Q00587	391 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	EMC2	Q15006	297 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	UBXN11	Q5T124	520 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	KANK3	Q6NY19	840 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	C4orf19	Q8IY42	314 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	EDA	Q92838	391 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	GTF3C6	Q969F1	213 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	GBP3	Q9H0R5	595 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	BTBD18	B2RXH4	712 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	TBX3	O15119	743 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	MARCH6	O60337	910 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	ZNF623	O75123	536 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	SLITRK3	O94933	977 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	CXCL14	O95715	111 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	GALT	P07902	379 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	WEE2	P0C1S8	567 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	XBP1	P17861	261 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	CA8	P35219	290 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	KRT2	P35908	639 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	SLC11A1	P49279	550 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	ANAPC15	P60006	121 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	XKR9	Q5GH70	373 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	TPH2	Q8IWU9	490 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	VPS52	Q8N1B4	723 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
FAM204A-208	ENST00000487269	ZBP1	Q9H171	429 aa		13.31	□□□□□ -0.28

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