RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-212ENST00000484841 TECP42680 631 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-212ENST00000484841 NEK4P51957 841 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-212ENST00000484841 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-212ENST00000484841 SLC39A11Q8N1S5 342 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-212ENST00000484841 HAS1Q92839 578 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-212ENST00000484841 GTF3C6Q969F1 213 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-212ENST00000484841 TMEM143Q96AN5 459 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-212ENST00000484841 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-212ENST00000484841 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-212ENST00000484841 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 BCAR1P56945 870 aa22.51■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 CYP4A11Q02928 519 aa22.51■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 NR5A1Q13285 461 aa22.51■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 ME3Q16798 604 aa22.51■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 LONRF3Q496Y0 759 aa22.51■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 LLGL2Q6P1M3 1020 aa22.51■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 TPH2Q8IWU9 490 aa22.51■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 URGCPQ8TCY9 931 aa22.51■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 DYDC2Q96IM9 177 aa22.51■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 MTRQ99707 1265 aa22.51■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 RGL1Q9NZL6 768 aa22.51■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 MUTYHQ9UIF7 546 aa22.51■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 ARID2Q68CP9 1835 aa22.5■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 EMC2Q15006 297 aa22.5■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 CALCRLQ16602 461 aa22.5■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 CASP10Q92851 521 aa22.5■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 LPPQ93052 612 aa22.5■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.5■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 HIDE1A8MVS5 230 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 ZNF623O75123 536 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 ERLIN2O94905 339 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 FDPSP14324 419 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 FOSBP53539 338 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 NOMO2Q5JPE7 1267 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 ANKRD54Q6NXT1 300 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 NEMFO60524 1076 aa22.48■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 GIT2Q14161 759 aa22.48■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 TFDP1Q14186 410 aa22.48■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.48■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 RNF149Q8NC42 400 aa22.48■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 VN1R2Q8NFZ6 395 aa22.48■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 GBP3Q9H0R5 595 aa22.48■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa22.48■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 FAM205CA6NFA0 338 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 CXCL14O95715 111 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 TXKP42681 527 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 CES5AQ6NT32 575 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 FERMT3Q86UX7 667 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 CNNM3Q8NE01 707 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 APOL5Q9BWW9 433 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 TBC1D13Q9NVG8 400 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 KANSL3Q9P2N6 904 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 BTBD18B2RXH4 712 aa22.46■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 LOC730098B7Z3J9 87 aa22.46■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 OFD1O75665 1012 aa22.46■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 LARGE1O95461 756 aa22.46■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 VPS52Q8N1B4 723 aa22.46■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 TNFRSF25Q93038 417 aa22.46■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 MFSD14AQ96MC6 490 aa22.46■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa22.46■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa22.46■■□□□ 1.19
ACTB-212ENST00000484841 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 C2orf71A6NGG8 1288 aa22.45■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 SLITRK3O94933 977 aa22.45■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.45■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.45■■□□□ 1.185e-27■■■■■ 34.2
ACTB-212ENST00000484841 EDAQ92838 391 aa22.45■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 RSAD1Q9HA92 442 aa22.45■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 UBN1Q9NPG3 1134 aa22.45■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.45■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 STK39Q9UEW8 545 aa22.45■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa22.45■■□□□ 1.18
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