RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472461.1

SZRD1-205, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene SZRD1, Length 843 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-205ENST00000472461 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
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SZRD1-205ENST00000472461 TMEM40Q8WWA1 233 aa20.51■□□□□ 0.87
SZRD1-205ENST00000472461 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SZRD1-205ENST00000472461 SMARCE1Q969G3 411 aa20.51■□□□□ 0.87
SZRD1-205ENST00000472461 OLFML3Q9NRN5 406 aa20.51■□□□□ 0.87
SZRD1-205ENST00000472461 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
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SZRD1-205ENST00000472461 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa20.5■□□□□ 0.87
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SZRD1-205ENST00000472461 FAM26FQ5R3K3 315 aa20.49■□□□□ 0.87
SZRD1-205ENST00000472461 ZNF720Q7Z2F6 126 aa20.49■□□□□ 0.87
SZRD1-205ENST00000472461 DEFB128Q7Z7B8 93 aa20.49■□□□□ 0.87
SZRD1-205ENST00000472461 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa20.49■□□□□ 0.87
SZRD1-205ENST00000472461 HPS3Q969F9 1004 aa20.49■□□□□ 0.87
SZRD1-205ENST00000472461 TMEM134Q9H6X4 195 aa20.49■□□□□ 0.87
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SZRD1-205ENST00000472461 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa20.48■□□□□ 0.87
SZRD1-205ENST00000472461 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa20.48■□□□□ 0.87
SZRD1-205ENST00000472461 ERLIN2O94905 339 aa20.47■□□□□ 0.87
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SZRD1-205ENST00000472461 KLHL40Q2TBA0 621 aa20.47■□□□□ 0.87
SZRD1-205ENST00000472461 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SZRD1-205ENST00000472461 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.47■□□□□ 0.87
SZRD1-205ENST00000472461 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SZRD1-205ENST00000472461 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SZRD1-205ENST00000472461 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.47■□□□□ 0.87
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SZRD1-205ENST00000472461 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa20.47■□□□□ 0.87
SZRD1-205ENST00000472461 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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SZRD1-205ENST00000472461 MYBP10242 640 aa20.46■□□□□ 0.87
SZRD1-205ENST00000472461 GTF2BQ00403 316 aa20.46■□□□□ 0.87
SZRD1-205ENST00000472461 ALCAMQ13740 583 aa20.46■□□□□ 0.87
SZRD1-205ENST00000472461 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa20.46■□□□□ 0.87
SZRD1-205ENST00000472461 CCDC183Q5T5S1 534 aa20.46■□□□□ 0.87
SZRD1-205ENST00000472461 SEPT8Q92599 483 aa20.46■□□□□ 0.87
SZRD1-205ENST00000472461 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.46■□□□□ 0.87
SZRD1-205ENST00000472461 ERVK-5Q9HDB9 667 aa20.46■□□□□ 0.87
SZRD1-205ENST00000472461 TBX20Q9UMR3 447 aa20.46■□□□□ 0.87
SZRD1-205ENST00000472461 PFKMP08237 780 aa20.45■□□□□ 0.86
SZRD1-205ENST00000472461 CASP5P51878 434 aa20.45■□□□□ 0.86
SZRD1-205ENST00000472461 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SZRD1-205ENST00000472461 STK4Q13043 487 aa20.45■□□□□ 0.86
SZRD1-205ENST00000472461 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SZRD1-205ENST00000472461 FAM187BQ17R55 369 aa20.45■□□□□ 0.86
SZRD1-205ENST00000472461 TMEM132AQ24JP5 1023 aa20.45■□□□□ 0.86
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