RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468693.5

HCLS1-204, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 3

Gene HCLS1, Length 502 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-204	ENST00000468693	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		12.51	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	ZBTB5	O15062	677 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	HMMR	O75330	724 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	GLUD1	P00367	558 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	SLC11A1	P49279	550 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	PFKP	Q01813	784 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	NLRX1	Q86UT6	975 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	DGKH	Q86XP1	1220 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	HOMER1	Q86YM7	354 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	MTMR8	Q96EF0	704 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	KAT14	Q9H8E8	782 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	NEDD4	P46934	1319 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	TEX28	O15482	410 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	GPR32	O75388	356 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	VTN	P04004	478 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	ZNF806	P0C7X5	589 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	FSHR	P23945	695 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	AK2	P54819	239 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	NTHL1	P78549	312 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	PPP2R5D	Q14738	602 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	LONRF3	Q496Y0	759 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	GBP3	Q9H0R5	595 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	AZI2	Q9H6S1	392 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	CDH7	Q9ULB5	785 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693		A0A0U1RQF3	1178 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	PAPLN	O95428	1278 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	FGA	P02671	866 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	ADH1A	P07327	375 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	ITGB5	P18084	799 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	HOXC13	P31276	330 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	CCR3	P51677	355 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	RNF43	Q68DV7	783 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	MTSS1L	Q765P7	747 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	CEP68	Q76N32	757 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	POTED	Q86YR6	584 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	MIER1	Q8N108	512 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	PANK1	Q8TE04	598 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	LPP	Q93052	612 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	ALX1	Q15699	326 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	PALB2	Q86YC2	1186 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	FGF13	Q92913	245 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	TCEAL3	Q969E4	200 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	GPRASP2	Q96D09	838 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	PIGS	Q96S52	555 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	KLRF2	D3W0D1	207 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	UROD	P06132	367 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	FGFR4	P22455	802 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	CNR2	P34972	360 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	CXCL12	P48061	93 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	STAT5B	P51692	787 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	GAS6	Q14393	721 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	LONP2	Q86WA8	852 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	PROSER1	Q86XN7	944 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
HCLS1-204	ENST00000468693	DPP7	Q9UHL4	492 aa		12.46	□□□□□ -0.41

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