RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	ZSCAN12	O43309	604 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	HBP1	O60381	514 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	HOXC6	P09630	235 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	KRT13	P13646	458 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	TM4SF4	P48230	202 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	BFSP1	Q12934	665 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	CAPS	Q13938	189 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	MTF1	Q14872	753 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	TCP11	Q8WWU5	503 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	USP6NL	Q92738	828 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	KCNN1	Q92952	543 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	ZIC5	Q96T25	663 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	CEP72	Q9P209	647 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	EVPL	Q92817	2033 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	MAPK13	O15264	365 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	CA12	O43570	354 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	MMP3	P08254	477 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF286B	P0CG31	522 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	TRIM49	P0CI25	452 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	TRIM49C	P0CI26	452 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	CYP2B6	P20813	491 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	STRN3	Q13033	797 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	DRP2	Q13474	957 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	IRF5	Q13568	498 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	MEA1	Q16626	185 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	IER5	Q5VY09	327 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	PDXDC1	Q6P996	788 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	DESI2	Q9BSY9	194 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	COL1A2	P08123	1366 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	LRRC53	A6NM62	1247 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	ADCY6	O43306	1168 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	ADRB2	P07550	413 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	CCDC175	P0C221	793 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	CNGA1	P29973	690 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	FMO5	P49326	533 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	LIG4	P49917	911 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	MYL7	Q01449	175 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	TNFAIP2	Q03169	654 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	PTPN14	Q15678	1187 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	CCL14	Q16627	93 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	WDR59	Q6PJI9	974 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	GBP6	Q6ZN66	633 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	RDH13	Q8NBN7	331 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	BAP1	Q92560	729 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	SAAL1	Q96ER3	474 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	GAN	Q9H2C0	597 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	GCNT4	Q9P109	453 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	KAT6A	Q92794	2004 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	ADCY3	O60266	1144 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	NOL4	O94818	638 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	TOMM70	O94826	608 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	C22orf31	O95567	290 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	PIGR	P01833	764 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	TNNT1	P13805	278 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC9A1	P19634	815 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	GART	P22102	1010 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	ADSS	P30520	456 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	VAMP7	P51809	220 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	FCGRT	P55899	365 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDLBP-231	ENST00000467435	RRAGA	Q7L523	313 aa		13.41	□□□□□ -0.26

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