RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465634.5

TRIM5-208, Transcript of tripartite motif containing 5, human

TSL 1 (best)

Gene TRIM5, Length 602 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRIM5-208	ENST00000465634	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634		A0A087WZ62	844 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	DENND3	A2RUS2	1198 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634		K7ENM7	598 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	SLC16A4	O15374	487 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	PPP1R37	O75864	691 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	GCNT3	O95395	438 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	CHRNA1	P02708	482 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	CLTB	P09497	229 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	CCDC192	P0DO97	292 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	SELP	P16109	830 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	NLRP12	P59046	1061 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	MGAT3	Q09327	533 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	STRN3	Q13033	797 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	MAPK6	Q16659	721 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	KSR1	Q8IVT5	923 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	HIPK3	Q9H422	1215 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	FZD8	Q9H461	694 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	TMEM206	Q9H813	350 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	ANO10	Q9NW15	660 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	TBX21	Q9UL17	535 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	TBX20	Q9UMR3	447 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	ARID2	Q68CP9	1835 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	ACKR2	O00590	384 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	KIAA0355	O15063	1070 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	GPR182	O15218	404 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	CAVIN2	O95810	425 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	10.61	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	AXL	P30530	894 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	WNT8B	Q93098	351 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	ACCS	Q96QU6	501 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	SYCE3	A1L190	88 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	BIN1	O00499	593 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	PSMA7	O14818	248 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	TIMP1	P01033	207 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	PIGR	P01833	764 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	IQCF3	P0C7M6	154 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	BMP6	P22004	513 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	RFC2	P35250	354 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	PRCP	P42785	496 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	STX1A	Q16623	288 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	ZPBP2	Q6X784	338 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	ADSSL1	Q8N142	457 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	HPS3	Q969F9	1004 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	OSMR	Q99650	979 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	CHST12	Q9NRB3	414 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	GINS2	Q9Y248	185 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	KAT6A	Q92794	2004 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	BICDL2	A1A5D9	508 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	PDXK	O00764	312 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	RPS6KA5	O75582	802 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	ERLIN2	O94905	339 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	PRKCB	P05771	671 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TRIM5-208	ENST00000465634	CTSH	P09668	335 aa		10.59	□□□□□ -0.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms