RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455580.5

PPP1CB-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PPP1CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-208ENST00000455580 TLR9Q9NR96 1032 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 A0A087WWV3 80 aa26.74■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 LINC01565O15544 149 aa26.74■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 ST18O60284 1047 aa26.74■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 TECP42680 631 aa26.74■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 TRAPPC10P48553 1259 aa26.74■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 RAB27AP51159 221 aa26.74■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 ERVFC1P60507 584 aa26.74■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 TTC38Q5R3I4 469 aa26.74■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 CATSPER3Q86XQ3 398 aa26.74■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 RSPH1Q8WYR4 309 aa26.74■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 TUFT1Q9NNX1 390 aa26.74■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa26.74■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa26.73■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 FSCN2O14926 492 aa26.73■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 OR52Z1P0C646 297 aa26.73■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP26.73■■□□□ 1.879e-7■■■□□ 17
PPP1CB-208ENST00000455580 ARL2P36404 184 aa26.73■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 NRIP1P48552 1158 aa26.73■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 PTENP60484 403 aa26.73■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 POU5F1BQ06416 359 aa26.73■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 EFHBQ8N7U6 833 aa26.73■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 LPPQ93052 612 aa26.73■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 CD320Q9NPF0 282 aa26.73■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 MED24O75448 989 aa26.72■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 PPM1AP35813 382 aa26.72■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 PBX3P40426 434 aa26.72■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 C4orf32Q8N8J7 132 aa26.72■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 TLE6Q9H808 572 aa26.72■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 SPG21Q9NZD8 308 aa26.72■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 FAM50BQ9Y247 325 aa26.72■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa26.72■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 MEIS3P2A8K0S8 358 aa26.71■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 TBX10O75333 385 aa26.71■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 KRT17Q04695 432 aa26.71■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 TFDP1Q14186 410 aa26.71■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP26.71■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 LONRF3Q496Y0 759 aa26.71■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 ASAP3Q8TDY4 903 aa26.71■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 PGBD4Q96DM1 585 aa26.71■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
PPP1CB-208ENST00000455580 OFD1O75665 1012 aa26.7■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 RPA1P27694 616 aa26.7■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 UBXN11Q5T124 520 aa26.7■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 GLB1LQ6UWU2 654 aa26.7■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 SLC39A11Q8N1S5 342 aa26.7■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 NACC1Q96RE7 527 aa26.7■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 CLEC1BQ9P126 229 aa26.7■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 BDP1A6H8Y1 2624 aa26.69■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 ARID2Q68CP9 1835 aa26.69■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 NDUFV1P49821 464 aa26.69■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 BCAR1P56945 870 aa26.69■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 CAPSQ13938 189 aa26.69■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 CLUL1Q15846 466 aa26.69■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 NOMO2Q5JPE7 1267 aa26.69■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 AGMOQ6ZNB7 445 aa26.69■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 GJD3Q8N144 294 aa26.69■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 ERMNQ8TAM6 284 aa26.69■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 TMX3Q96JJ7 454 aa26.69■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 MSLNLQ96KJ4 702 aa26.69■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 CD207Q9UJ71 328 aa26.69■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 PER2O15055 1255 aa26.68■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 MBTPS2O43462 519 aa26.68■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 ERLIN2O94905 339 aa26.68■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 GLRA2P23416 452 aa26.68■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 AXLP30530 894 aa26.68■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 NBR1Q14596 966 aa26.68■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 NFKBIZQ9BYH8 718 aa26.68■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 TBC1D13Q9NVG8 400 aa26.68■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 PRKAG3Q9UGI9 489 aa26.68■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 KIF3AQ9Y496 699 aa26.68■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa26.67■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 TSPAN1O60635 241 aa26.67■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 USO1O60763 962 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 GLP2RO95838 553 aa26.67■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP26.67■■□□□ 1.861e-7■■■□□ 15.6
PPP1CB-208ENST00000455580 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 DUSP6Q16828 381 aa26.67■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 TCF25Q9BQ70 676 aa26.67■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa26.67■■□□□ 1.86
PPP1CB-208ENST00000455580 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa26.67■■□□□ 1.86
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