RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PHF12Q96QT6 1004 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPP1R16BQ96T49 567 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZBED2Q9BTP6 218 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RCOR1Q9UKL0 485 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MYO9BQ13459 2157 aa12.45□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DENND3A2RUS2 1198 aa12.44□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LPXNO60711 386 aa12.44□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 USO1O60763 962 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SKIP12755 728 aa12.44□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AXLP30530 894 aa12.44□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NAMPTP43490 491 aa12.44□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 USP49Q70CQ1 688 aa12.44□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ECHDC2Q86YB7 292 aa12.44□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCDC51Q96ER9 411 aa12.44□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRIMPOLQ96LW4 560 aa12.44□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NLRP4Q96MN2 994 aa12.44□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CSRNP2Q9H175 543 aa12.44□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GPRC5CQ9NQ84 441 aa12.44□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RNF19AQ9NV58 838 aa12.44□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LMCD1Q9NZU5 365 aa12.44□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UNC80Q8N2C7 3258 aa12.43□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A0A1B0GUA9 196 aa12.43□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 INPPL1O15357 1258 aa12.43□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UPP2O95045 317 aa12.43□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RB1P06400 928 aa12.43□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PLA2G4BP0C869 781 aa12.43□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FGFR4P22455 802 aa12.43□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RAB27AP51159 221 aa12.43□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ADGRE1Q14246 886 aa12.43□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BECN1Q14457 450 aa12.43□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPP2R5AQ15172 486 aa12.43□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NAALADL2Q58DX5 795 aa12.43□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ARSHQ5FYA8 562 aa12.43□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UBXN11Q5T124 520 aa12.43□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CATSPER4Q7RTX7 472 aa12.43□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BSNDQ8WZ55 320 aa12.43□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CALML4Q96GE6 196 aa12.43□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EPSTI1Q96J88 318 aa12.43□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 YME1L1Q96TA2 773 aa12.43□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RUSC1Q9BVN2 902 aa12.43□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCDC113Q9H0I3 377 aa12.43□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C2orf40Q9H1Z8 148 aa12.43□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KCNG1Q9UIX4 513 aa12.43□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa12.43□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 XIRP2A4UGR9 3374 aa12.43□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa12.42□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EPOPA6NHQ4 379 aa12.42□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ACKR2O00590 384 aa12.42□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPTLC2O15270 562 aa12.42□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HOXA2O43364 376 aa12.42□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TSPAN1O60635 241 aa12.42□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BMPR1AP36894 532 aa12.42□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF131P52739 623 aa12.42□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EFNA5P52803 228 aa12.42□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM102BQ5T8I3 360 aa12.42□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM117BQ6P1L5 589 aa12.42□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPRED2Q7Z698 418 aa12.42□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPIRE2Q8WWL2 714 aa12.42□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SCLT1Q96NL6 688 aa12.42□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CASD1Q96PB1 797 aa12.42□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PLVAPQ9BX97 442 aa12.42□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM117Q9H0C3 514 aa12.42□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRDM12Q9H4Q4 367 aa12.42□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM134Q9H6X4 195 aa12.42□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM105AQ9NUU6 356 aa12.42□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa12.42□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RWDD3Q9Y3V2 267 aa12.42□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 H3BNC9 293 aa12.41□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PLCG1P19174 1290 aa12.41□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SCP2P22307 547 aa12.41□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KARSQ15046 597 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EPC2Q52LR7 807 aa12.41□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM192Q8IY95 271 aa12.41□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FIBCD1Q8N539 461 aa12.41□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CNNM3Q8NE01 707 aa12.41□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MYLIPQ8WY64 445 aa12.41□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RAD54LQ92698 747 aa12.41□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 P2RX5Q93086 422 aa12.41□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa12.41□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DRC1Q96MC2 740 aa12.41□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM161BQ96MY7 647 aa12.41□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CLIC6Q96NY7 704 aa12.41□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C17orf80Q9BSJ5 609 aa12.41□□□□□ -0.42
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms