RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		16.19	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		16.19	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	16.19	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	16.18	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		16.18	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	DGKI	O75912	1065 aa		16.18	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	PBX2	P40425	430 aa		16.18	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	RABGGTB	P53611	331 aa		16.18	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		16.18	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	16.18	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	16.18	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		16.18	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	16.18	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	16.18	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	YME1L1	Q96TA2	773 aa		16.18	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF576	Q9H609	170 aa		16.18	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		16.18	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	16.18	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	16.18	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		16.18	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	16.18	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		16.18	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		16.18	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241		H0YCG3	227 aa		16.17	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF623	O75123	536 aa		16.17	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	HIP1R	O75146	1068 aa		16.17	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	ABCD1	P33897	745 aa		16.17	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	ME1	P48163	572 aa		16.17	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	MAPK7	Q13164	816 aa		16.17	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		16.17	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	USP49	Q70CQ1	688 aa		16.17	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		16.17	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	16.17	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	DEFB123	Q8N688	67 aa		16.17	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		16.17	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		16.17	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	SAMD11	Q96NU1	681 aa		16.17	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	PLIN2	Q99541	437 aa		16.17	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	16.17	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		16.17	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		16.17	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	FZD8	Q9H461	694 aa		16.17	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	16.17	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		16.17	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	16.17	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		16.17	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		16.16	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	16.16	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	CA3	P07451	260 aa		16.16	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	16.16	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	SMTN	P53814	917 aa		16.16	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	MAPK6	Q16659	721 aa		16.16	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	SPECC1	Q5M775	1068 aa		16.16	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	16.16	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	NOTUM	Q6P988	496 aa		16.16	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	GPBP1	Q86WP2	473 aa		16.16	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		16.16	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	DAW1	Q8N136	415 aa		16.16	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	CNNM3	Q8NE01	707 aa		16.16	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	16.16	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	BSND	Q8WZ55	320 aa		16.16	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	SPATA32	Q96LK8	384 aa		16.16	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		16.16	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	16.16	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		16.16	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		16.16	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		16.16	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	TSPAN1	O60635	241 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	16.15	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	UPP2	O95045	317 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	PLS3	P13797	630 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	MYOG	P15173	224 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	FGFR4	P22455	802 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	STAT6	P42226	847 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	NPTX2	P47972	431 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF131	P52739	623 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	TAP1	Q03518	808 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	MCM6	Q14566	821 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	AMHR2	Q16671	573 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	16.15	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	ARSH	Q5FYA8	562 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	RESP18	Q5W5W9	173 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	ADAL	Q6DHV7	355 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	SHC4	Q6S5L8	630 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	16.15	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	SV2B	Q7L1I2	683 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	16.15	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	IQUB	Q8NA54	791 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	LRRC15	Q8TF66	581 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	16.15	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	SZT2	Q5T011	3432 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PTPA-222	ENST00000445241	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		16.14	■□□□□ 0.17

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