RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429490.5

SGMS1-203, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 3,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-203ENST00000429490 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
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SGMS1-203ENST00000429490 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa14.78□□□□□ -0.04
SGMS1-203ENST00000429490 PASD1Q8IV76 773 aa14.78□□□□□ -0.04
SGMS1-203ENST00000429490 RHOT2Q8IXI1 618 aa14.78□□□□□ -0.04
SGMS1-203ENST00000429490 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SGMS1-203ENST00000429490 KRT35Q92764 455 aa14.78□□□□□ -0.04
SGMS1-203ENST00000429490 SAAL1Q96ER3 474 aa14.78□□□□□ -0.04
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SGMS1-203ENST00000429490 PITPNM3Q9BZ71 974 aa14.78□□□□□ -0.04
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SGMS1-203ENST00000429490 TCP10L2B9ZVM9 353 aa14.77□□□□□ -0.04
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SGMS1-203ENST00000429490 EP400NLQ6ZTU2 488 aa14.77□□□□□ -0.04
SGMS1-203ENST00000429490 FMNL3Q8IVF7 1028 aa14.77□□□□□ -0.04
SGMS1-203ENST00000429490 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
SGMS1-203ENST00000429490 SLC35C1Q96A29 364 aa14.77□□□□□ -0.04
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SGMS1-203ENST00000429490 TMEM119Q4V9L6 283 aa14.77□□□□□ -0.05
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SGMS1-203ENST00000429490 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa14.77□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 APEX2Q9UBZ4 518 aa14.77□□□□□ -0.05
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SGMS1-203ENST00000429490 MYH15Q9Y2K3 1946 aa14.77□□□□□ -0.05
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SGMS1-203ENST00000429490 FOXO6A8MYZ6 492 aa14.77□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 UBOX5O94941 541 aa14.77□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 POLR2MP0CAP2 368 aa14.77□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 MARCKSL1P49006 195 aa14.77□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 PEX3P56589 373 aa14.77□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 MXRA7P84157 204 aa14.77□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 MAPK7Q13164 816 aa14.77□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 TAF11Q15544 211 aa14.77□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 SPDL1Q96EA4 605 aa14.77□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 SCN11AQ9UI33 1791 aa14.76□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 RASA4BC9J798 803 aa14.76□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 ATP2A1O14983 1001 aa14.76□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 RASA4O43374 803 aa14.76□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 CHRNA3P32297 505 aa14.76□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 KRT17Q04695 432 aa14.76□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 XKR9Q5GH70 373 aa14.76□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 YY1AP1Q9H869 796 aa14.76□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 KLHL11Q9NVR0 708 aa14.76□□□□□ -0.05
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SGMS1-203ENST00000429490 GOLGA8MH3BSY2 632 aa14.76□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 M0R2N6 131 aa14.76□□□□□ -0.05
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SGMS1-203ENST00000429490 RPA1P27694 616 aa14.76□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.051e-10■■■■■ 47.2
SGMS1-203ENST00000429490 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 INTUQ9ULD6 942 aa14.76□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 CA4P22748 312 aa14.75□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 DRP2Q13474 957 aa14.75□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 POMGNT1Q8WZA1 660 aa14.75□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 CCDC17Q96LX7 622 aa14.75□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 NACC1Q96RE7 527 aa14.75□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
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SGMS1-203ENST00000429490 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 FAM187AA6NFU0 413 aa14.75□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 SCFD2Q8WU76 684 aa14.75□□□□□ -0.05
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SGMS1-203ENST00000429490 TISP43B9A030 160 aa14.75□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 SLC16A4O15374 487 aa14.75□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 TMEM253P0C7T8 217 aa14.75□□□□□ -0.05
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SGMS1-203ENST00000429490 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 PIK3R5Q8WYR1 880 aa14.75□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 CSRNP1Q96S65 589 aa14.75□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 FAM129AQ9BZQ8 928 aa14.75□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 ERVK-5Q9HDB9 667 aa14.75□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 MSH4O15457 936 aa14.74□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 LCA5LO95447 670 aa14.74□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 RPL21P46778 160 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SGMS1-203ENST00000429490 DYNLT1P63172 113 aa14.74□□□□□ -0.05
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