RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428962.2

THBS3-202, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 2

Gene THBS3, Length 1,833 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-202ENST00000428962 HSPBP1Q9NZL4 362 aa14.86□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 ZNF112Q9UJU3 913 aa14.86□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 FAN1Q9Y2M0 1017 aa14.86□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 PHIPQ8WWQ0 1821 aa14.86□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 EMSYQ7Z589 1322 aa14.86□□□□□ -0.03
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THBS3-202ENST00000428962 PMM2O15305 246 aa14.85□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 TNFAIP3P21580 790 aa14.85□□□□□ -0.03
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THBS3-202ENST00000428962 TAF3Q5VWG9 929 aa14.85□□□□□ -0.03
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THBS3-202ENST00000428962 OTUD6AQ7L8S5 288 aa14.85□□□□□ -0.03
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THBS3-202ENST00000428962 RFFLQ8WZ73 363 aa14.85□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 ATP6V0A1Q93050 837 aa14.85□□□□□ -0.03
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THBS3-202ENST00000428962 FAM102BQ5T8I3 360 aa14.85□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
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THBS3-202ENST00000428962 SYT11Q9BT88 431 aa14.85□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 PCIF1Q9H4Z3 704 aa14.85□□□□□ -0.03
THBS3-202ENST00000428962 C17orf75Q9HAS0 396 aa14.85□□□□□ -0.03
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THBS3-202ENST00000428962 KRT12Q99456 494 aa14.83□□□□□ -0.04
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THBS3-202ENST00000428962 TMEM59LQ9UK28 342 aa14.83□□□□□ -0.04
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THBS3-202ENST00000428962 TBX20Q9UMR3 447 aa14.83□□□□□ -0.04
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THBS3-202ENST00000428962 PLA2G4FQ68DD2 849 aa14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 MAP4K3Q8IVH8 894 aa14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 OLIG1Q8TAK6 271 aa14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 AFAP1L1Q8TED9 768 aa14.82□□□□□ -0.04
THBS3-202ENST00000428962 SPIRE2Q8WWL2 714 aa14.82□□□□□ -0.04
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